More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1240 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1240  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  707    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0625222  hitchhiker  0.00968227 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1082  hypothetical protein  64.55 
 
 
350 aa  478  1e-134  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0793  hypothetical protein  65.8 
 
 
349 aa  471  1e-132  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0811  hypothetical protein  63.69 
 
 
350 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.836821  hitchhiker  0.000111453 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1356  hypothetical protein  64.84 
 
 
351 aa  444  1e-123  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.711945  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0551  hypothetical protein  52.74 
 
 
349 aa  382  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1932  hypothetical protein  50 
 
 
349 aa  369  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0292488  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1607  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  52.15 
 
 
350 aa  357  9.999999999999999e-98  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0020  hypothetical protein  50.29 
 
 
348 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0338  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  51.02 
 
 
347 aa  354  1e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.468823  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1390  hypothetical protein  52.3 
 
 
345 aa  353  2e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2510  hypothetical protein  49.28 
 
 
350 aa  349  4e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507027  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0764  hypothetical protein  51.02 
 
 
346 aa  341  9e-93  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0157  hypothetical protein  48.99 
 
 
350 aa  339  5e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2361  hypothetical protein  49.43 
 
 
350 aa  339  5e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1646  hypothetical protein  49.57 
 
 
348 aa  337  2.9999999999999997e-91  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0526  hypothetical protein  49.13 
 
 
349 aa  336  5e-91  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0458  hypothetical protein  49.42 
 
 
349 aa  335  9e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.288502  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1461  hypothetical protein  49.13 
 
 
349 aa  332  5e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1627  hypothetical protein  47.98 
 
 
347 aa  330  2e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0379  hypothetical protein  48.27 
 
 
349 aa  328  7e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1142  hypothetical protein  48.7 
 
 
349 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448183  hitchhiker  0.000356194 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0151  hypothetical protein  48.56 
 
 
350 aa  325  6e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3869  hypothetical protein  46.69 
 
 
348 aa  312  6.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0430  hypothetical protein  47.25 
 
 
348 aa  301  7.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.637557  normal  0.081806 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0982  hypothetical protein  48.12 
 
 
348 aa  301  8.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0597  protein of unknown function DUF35  28.37 
 
 
490 aa  123  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3069  hypothetical protein  26.89 
 
 
502 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.97 
 
 
913 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3240  hypothetical protein  28.53 
 
 
485 aa  113  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.57921  normal  0.496079 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4021  protein of unknown function DUF35  28.29 
 
 
481 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.605764  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2917  hypothetical protein  27.27 
 
 
495 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.381583  normal  0.0360554 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4422  protein of unknown function DUF35  28.41 
 
 
474 aa  94  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00766931  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1925  protein of unknown function DUF35  27.75 
 
 
474 aa  92.8  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1183  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.46 
 
 
325 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4396  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26.56 
 
 
369 aa  80.1  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0133862  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1856  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  26.1 
 
 
484 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0653145  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2055  protein of unknown function DUF35  29.19 
 
 
474 aa  77.4  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0203372  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2633  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.15 
 
 
325 aa  76.3  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3280  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.15 
 
 
325 aa  76.3  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4194  protein of unknown function DUF35  26.61 
 
 
473 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492043  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2505  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.63 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000055762  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8252  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26.69 
 
 
396 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112958  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0828  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  29.11 
 
 
464 aa  73.9  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0208074 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0611  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.62 
 
 
330 aa  73.9  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000255652 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5272  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.84 
 
 
325 aa  73.6  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1585  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.81 
 
 
316 aa  73.2  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421947  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2810  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.07 
 
 
317 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6810  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.76 
 
 
336 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0985  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.65 
 
 
318 aa  70.9  0.00000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2595  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  25.22 
 
 
413 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2608  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  25.2 
 
 
412 aa  70.5  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1989  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  25.55 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2518  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  25.2 
 
 
412 aa  70.5  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1516  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.62 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.103952  normal  0.0316921 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4399  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.39 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1583  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.1 
 
 
319 aa  69.7  0.00000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0414109  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2969  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  25.42 
 
 
397 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  hitchhiker  0.0000211937 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1293  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.22 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1095  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.22 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1077  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.22 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1071  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.22 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000173774  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1228  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.22 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2265  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.15 
 
 
326 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3727  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1719  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  24.13 
 
 
389 aa  68.2  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.396765  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1184  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.22 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4286  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.2 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.12567  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1255  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.22 
 
 
310 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2313  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  30 
 
 
447 aa  67.8  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.859835  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1332  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  21.9 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.985696  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3556  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  25.31 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.896137  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0890  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.22 
 
 
310 aa  67  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1684  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.86 
 
 
316 aa  67  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000249118  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3501  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.86 
 
 
316 aa  67  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246754  decreased coverage  0.00135682 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1576  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.86 
 
 
316 aa  67  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.70406e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1418  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.12 
 
 
321 aa  67  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.732664 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0602  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.78 
 
 
319 aa  67  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000174189  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51390  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.62 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116987 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0567  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.62 
 
 
313 aa  66.2  0.0000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0165  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.86 
 
 
316 aa  65.9  0.0000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.367012  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2075  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23.17 
 
 
335 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317439  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4114  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.22 
 
 
310 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1082  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  21.9 
 
 
310 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204932  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.43 
 
 
320 aa  64.7  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0762403  normal  0.118636 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2193  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.38 
 
 
356 aa  65.1  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1739  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  28.12 
 
 
447 aa  63.5  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1730  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.35 
 
 
325 aa  63.9  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2569  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  25.79 
 
 
388 aa  63.2  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0982  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.47 
 
 
313 aa  63.2  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000366102  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2622  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  25.79 
 
 
388 aa  63.2  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1001  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.47 
 
 
313 aa  63.2  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0148108  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1079  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  21.88 
 
 
329 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.796482 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1121  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  21.88 
 
 
329 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1136  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.09 
 
 
324 aa  63.2  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.896107  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2310  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  29.03 
 
 
445 aa  62.8  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0401  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  29.03 
 
 
445 aa  62.8  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0641  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  21.88 
 
 
329 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1215  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  22.52 
 
 
351 aa  62.8  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2003  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.16 
 
 
321 aa  62  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1324  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.31 
 
 
324 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.760998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>