More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1082 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0793  hypothetical protein  91.09 
 
 
349 aa  645    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0811  hypothetical protein  86 
 
 
350 aa  647    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.836821  hitchhiker  0.000111453 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1082  hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  710    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1356  hypothetical protein  86 
 
 
351 aa  597  1e-169  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.711945  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1240  hypothetical protein  64.55 
 
 
349 aa  478  1e-134  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0625222  hitchhiker  0.00968227 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0551  hypothetical protein  55.2 
 
 
349 aa  402  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1932  hypothetical protein  53.31 
 
 
349 aa  383  1e-105  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0292488  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0338  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  52.77 
 
 
347 aa  375  1e-103  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.468823  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1607  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  52.72 
 
 
350 aa  372  1e-102  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0020  hypothetical protein  51.3 
 
 
348 aa  374  1e-102  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1646  hypothetical protein  50.43 
 
 
348 aa  362  6e-99  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1390  hypothetical protein  51.59 
 
 
345 aa  358  6e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0157  hypothetical protein  50.43 
 
 
350 aa  356  3.9999999999999996e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0151  hypothetical protein  52.15 
 
 
350 aa  352  5e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2510  hypothetical protein  48.14 
 
 
350 aa  352  7e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507027  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2361  hypothetical protein  48.13 
 
 
350 aa  347  2e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0526  hypothetical protein  49.43 
 
 
349 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1627  hypothetical protein  48.27 
 
 
347 aa  342  5.999999999999999e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0764  hypothetical protein  48.26 
 
 
346 aa  340  2e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1461  hypothetical protein  48.29 
 
 
349 aa  333  2e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0458  hypothetical protein  48 
 
 
349 aa  332  8e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.288502  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0379  hypothetical protein  47.71 
 
 
349 aa  328  6e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1142  hypothetical protein  46.92 
 
 
349 aa  327  3e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448183  hitchhiker  0.000356194 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3869  hypothetical protein  45.38 
 
 
348 aa  318  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0430  hypothetical protein  47.66 
 
 
348 aa  303  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.637557  normal  0.081806 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0982  hypothetical protein  47.38 
 
 
348 aa  300  3e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4021  protein of unknown function DUF35  27.91 
 
 
481 aa  112  8.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.605764  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0597  protein of unknown function DUF35  25.92 
 
 
490 aa  109  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3240  hypothetical protein  27.52 
 
 
485 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.57921  normal  0.496079 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2917  hypothetical protein  27.65 
 
 
495 aa  98.2  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.381583  normal  0.0360554 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3069  hypothetical protein  26.55 
 
 
502 aa  97.4  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.06 
 
 
913 aa  96.7  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4396  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  25.63 
 
 
369 aa  89  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0133862  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4422  protein of unknown function DUF35  27.64 
 
 
474 aa  87.8  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00766931  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1856  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  25.9 
 
 
484 aa  83.2  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0653145  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1925  protein of unknown function DUF35  26.33 
 
 
474 aa  79.7  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1154  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.92 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000934298  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1583  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.97 
 
 
319 aa  75.5  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0414109  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1719  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  24 
 
 
389 aa  74.3  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.396765  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8252  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  25.97 
 
 
396 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112958  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2518  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  25 
 
 
412 aa  72.8  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2608  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  25 
 
 
412 aa  72.8  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2569  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26.03 
 
 
388 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2055  protein of unknown function DUF35  30 
 
 
474 aa  72.4  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0203372  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2622  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26.03 
 
 
388 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0744  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  22.29 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.968089  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0031  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  21.94 
 
 
336 aa  70.9  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0645987  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2310  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  29.96 
 
 
445 aa  70.5  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1372  3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA synthase  23.45 
 
 
387 aa  70.5  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.998569  hitchhiker  0.00000000102593 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2418  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.15 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3556  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  25 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.896137  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2842  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.38 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.61653  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2122  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  22.55 
 
 
388 aa  70.1  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2750  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  24.38 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2969  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  25.35 
 
 
397 aa  70.1  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  hitchhiker  0.0000211937 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0602  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.32 
 
 
319 aa  69.7  0.00000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000174189  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4233  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.09 
 
 
329 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338438  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1989  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  25.45 
 
 
334 aa  69.3  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1666  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  23.14 
 
 
384 aa  68.9  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.696762  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23.72 
 
 
339 aa  68.2  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.707185  normal  0.207521 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2934  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.06 
 
 
326 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1079  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.46 
 
 
329 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.796482 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1593  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  26.16 
 
 
323 aa  68.2  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00182036  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1121  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.46 
 
 
329 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0401  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  29.49 
 
 
445 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1183  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.77 
 
 
325 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1585  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.2 
 
 
316 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421947  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2141  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  21.88 
 
 
335 aa  67.8  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0098  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) synthase  22.09 
 
 
346 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.795043 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0666  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.25 
 
 
325 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.52577  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1516  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  27.64 
 
 
333 aa  67.4  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.103952  normal  0.0316921 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1316  HMG-CoA synthase  23.61 
 
 
390 aa  67.4  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.717019  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3837  Beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase I  21.78 
 
 
346 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2505  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.14 
 
 
317 aa  67.4  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000055762  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0641  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.46 
 
 
329 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01750  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.81 
 
 
342 aa  67  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.425442 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2075  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  22.39 
 
 
335 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317439  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2183  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.77 
 
 
329 aa  67  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415325  normal  0.0499855 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2739  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.55 
 
 
326 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.12716  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6948  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  22.39 
 
 
332 aa  67  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.747585  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2366  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  23.2 
 
 
325 aa  66.6  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10544  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25 
 
 
335 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.66749e-72  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1739  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  31.96 
 
 
447 aa  66.2  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0621  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase (HMG-CoA synthase)  24.86 
 
 
391 aa  66.2  0.0000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000102903  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0828  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  24.15 
 
 
464 aa  65.5  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0208074 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1072  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.45 
 
 
319 aa  65.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2633  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.58 
 
 
325 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3280  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.58 
 
 
325 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4194  protein of unknown function DUF35  25.95 
 
 
473 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492043  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1717  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.8 
 
 
329 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1669  Beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase I  22.75 
 
 
337 aa  64.7  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1136  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  21.74 
 
 
324 aa  64.3  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.896107  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2560  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23.38 
 
 
333 aa  63.9  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0713  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  20.45 
 
 
331 aa  63.5  0.000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.36705 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5272  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.93 
 
 
325 aa  63.5  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20950  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.91 
 
 
330 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0890  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  21.9 
 
 
310 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16750  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.83 
 
 
333 aa  62.8  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0510384  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0611  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.84 
 
 
330 aa  62.8  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000255652 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1184  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  21.79 
 
 
310 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>