More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3869 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3869  hypothetical protein  100 
 
 
348 aa  704    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1142  hypothetical protein  70.61 
 
 
349 aa  521  1e-147  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448183  hitchhiker  0.000356194 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0430  hypothetical protein  70.03 
 
 
348 aa  488  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.637557  normal  0.081806 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0982  hypothetical protein  70.03 
 
 
348 aa  484  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0764  hypothetical protein  60.06 
 
 
346 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0551  hypothetical protein  54.94 
 
 
349 aa  377  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0020  hypothetical protein  52.33 
 
 
348 aa  372  1e-102  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2510  hypothetical protein  55.01 
 
 
350 aa  374  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507027  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1932  hypothetical protein  53.2 
 
 
349 aa  371  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0292488  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1390  hypothetical protein  56.73 
 
 
345 aa  370  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0526  hypothetical protein  53.76 
 
 
349 aa  366  1e-100  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0157  hypothetical protein  54.47 
 
 
350 aa  366  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1461  hypothetical protein  54.05 
 
 
349 aa  362  6e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0458  hypothetical protein  53.76 
 
 
349 aa  360  2e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.288502  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1627  hypothetical protein  52.75 
 
 
347 aa  357  9.999999999999999e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0379  hypothetical protein  52.89 
 
 
349 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2361  hypothetical protein  53.31 
 
 
350 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0338  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  50.87 
 
 
347 aa  350  2e-95  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.468823  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0151  hypothetical protein  53.31 
 
 
350 aa  349  3e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1646  hypothetical protein  49.56 
 
 
348 aa  340  2e-92  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1607  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  48.1 
 
 
350 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0811  hypothetical protein  47.4 
 
 
350 aa  333  4e-90  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.836821  hitchhiker  0.000111453 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1082  hypothetical protein  45.38 
 
 
350 aa  323  4e-87  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1240  hypothetical protein  46.69 
 
 
349 aa  316  3e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0625222  hitchhiker  0.00968227 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0793  hypothetical protein  47.4 
 
 
349 aa  315  5e-85  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1356  hypothetical protein  48.27 
 
 
351 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.711945  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.57 
 
 
913 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2917  hypothetical protein  29.15 
 
 
495 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.381583  normal  0.0360554 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3069  hypothetical protein  26.78 
 
 
502 aa  100  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0597  protein of unknown function DUF35  27.32 
 
 
490 aa  96.3  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4021  protein of unknown function DUF35  27.32 
 
 
481 aa  95.5  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.605764  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1719  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  27.4 
 
 
389 aa  91.7  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.396765  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4194  protein of unknown function DUF35  27.65 
 
 
473 aa  90.1  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492043  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3240  hypothetical protein  27.95 
 
 
485 aa  89.7  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.57921  normal  0.496079 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4422  protein of unknown function DUF35  27.25 
 
 
474 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00766931  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8252  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  27.48 
 
 
396 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112958  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1184  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  28.05 
 
 
385 aa  80.1  0.00000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.298537  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2569  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  24.61 
 
 
388 aa  75.1  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1925  protein of unknown function DUF35  28.01 
 
 
474 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2622  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  24.61 
 
 
388 aa  75.1  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0744  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.24 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.968089  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0676  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  25.71 
 
 
385 aa  72.8  0.000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000283469  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2055  protein of unknown function DUF35  27.17 
 
 
474 aa  72.4  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0203372  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1516  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  27.27 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.103952  normal  0.0316921 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01750  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.8 
 
 
342 aa  69.7  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.425442 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1989  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  25.67 
 
 
334 aa  69.3  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2987  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.71 
 
 
342 aa  67.4  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00208212  normal  0.0221839 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2310  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  25.15 
 
 
445 aa  66.2  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3556  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  24.53 
 
 
319 aa  66.6  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.896137  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2075  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23.01 
 
 
335 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317439  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2122  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  23.1 
 
 
388 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2766  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  27.46 
 
 
444 aa  64.7  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2502  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  22.05 
 
 
337 aa  64.7  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0775365 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2490  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.56 
 
 
327 aa  63.9  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.201927 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2803  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  22.93 
 
 
346 aa  63.9  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0023  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  27.53 
 
 
324 aa  63.9  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2313  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  24.2 
 
 
447 aa  62.8  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.859835  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9238  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.52 
 
 
323 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6810  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.32 
 
 
336 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1856  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  27.19 
 
 
484 aa  62.4  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0653145  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1583  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.49 
 
 
319 aa  62.4  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0414109  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16750  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  27.07 
 
 
333 aa  62  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0510384  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0401  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  23.72 
 
 
445 aa  60.8  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1316  HMG-CoA synthase  26.15 
 
 
390 aa  60.8  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.717019  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00675  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) synthase  22.95 
 
 
338 aa  61.2  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2595  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26.74 
 
 
413 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3017  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.38 
 
 
348 aa  60.8  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1414  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  22.33 
 
 
333 aa  61.2  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.662472 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0518  hypothetical protein  28.49 
 
 
342 aa  61.2  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.397624  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0682  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  19.21 
 
 
332 aa  60.5  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0139915  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4399  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.05 
 
 
337 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0968  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  25.44 
 
 
389 aa  60.8  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0567  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  28.32 
 
 
339 aa  60.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.140708  normal  0.209954 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0713  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  21.14 
 
 
331 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.36705 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2505  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.75 
 
 
317 aa  60.1  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000055762  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07545  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase  21.71 
 
 
335 aa  60.1  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0890  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  20.79 
 
 
310 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51390  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.43 
 
 
337 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1326  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.69 
 
 
325 aa  59.7  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1136  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.29 
 
 
324 aa  59.7  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.896107  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1372  3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA synthase  23.84 
 
 
387 aa  59.3  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.998569  hitchhiker  0.00000000102593 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2183  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.03 
 
 
329 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415325  normal  0.0499855 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4396  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26.54 
 
 
369 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0133862  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1645  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  21.98 
 
 
344 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10544  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.17 
 
 
335 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.66749e-72  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1291  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  21.8 
 
 
383 aa  58.5  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2810  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.79 
 
 
317 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1666  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  24.61 
 
 
384 aa  58.2  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.696762  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2467  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.25 
 
 
353 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000376191  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2969  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  23.37 
 
 
397 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  hitchhiker  0.0000211937 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2608  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  23.37 
 
 
412 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0433  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.5 
 
 
346 aa  57.4  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0463016  normal  0.192423 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2518  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  23.37 
 
 
412 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1338  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.44 
 
 
327 aa  57  0.0000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0113  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  21.39 
 
 
332 aa  57  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1255  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  20.46 
 
 
310 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1228  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  20.79 
 
 
310 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0359  putative hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  23.84 
 
 
437 aa  57  0.0000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2739  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23.36 
 
 
326 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.12716  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02910  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.37 
 
 
316 aa  57  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>