More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0811 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0793  hypothetical protein  89.37 
 
 
349 aa  640    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0811  hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  712    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.836821  hitchhiker  0.000111453 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1082  hypothetical protein  86 
 
 
350 aa  647    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1356  hypothetical protein  88 
 
 
351 aa  615  1e-175  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.711945  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1240  hypothetical protein  63.69 
 
 
349 aa  470  1.0000000000000001e-131  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0625222  hitchhiker  0.00968227 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0551  hypothetical protein  54.91 
 
 
349 aa  404  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1932  hypothetical protein  55.33 
 
 
349 aa  397  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0292488  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0020  hypothetical protein  52.74 
 
 
348 aa  382  1e-105  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1607  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  53.01 
 
 
350 aa  376  1e-103  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0338  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  53.06 
 
 
347 aa  377  1e-103  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.468823  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1390  hypothetical protein  54.76 
 
 
345 aa  374  1e-102  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0157  hypothetical protein  52.17 
 
 
350 aa  368  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1646  hypothetical protein  52.44 
 
 
348 aa  369  1e-101  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2361  hypothetical protein  50.72 
 
 
350 aa  365  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2510  hypothetical protein  50.43 
 
 
350 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507027  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0151  hypothetical protein  51 
 
 
350 aa  351  1e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0764  hypothetical protein  51.45 
 
 
346 aa  350  3e-95  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0526  hypothetical protein  51.14 
 
 
349 aa  349  4e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1627  hypothetical protein  48.27 
 
 
347 aa  347  2e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1461  hypothetical protein  50.29 
 
 
349 aa  346  3e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0458  hypothetical protein  50 
 
 
349 aa  342  5e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.288502  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0379  hypothetical protein  49.71 
 
 
349 aa  342  7e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1142  hypothetical protein  50.44 
 
 
349 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448183  hitchhiker  0.000356194 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3869  hypothetical protein  47.4 
 
 
348 aa  327  2.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0430  hypothetical protein  49.56 
 
 
348 aa  310  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.637557  normal  0.081806 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0982  hypothetical protein  49.42 
 
 
348 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4021  protein of unknown function DUF35  28.99 
 
 
481 aa  117  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.605764  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0597  protein of unknown function DUF35  27.25 
 
 
490 aa  114  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3240  hypothetical protein  27.73 
 
 
485 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.57921  normal  0.496079 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.51 
 
 
913 aa  104  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3069  hypothetical protein  26.42 
 
 
502 aa  102  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2917  hypothetical protein  28.3 
 
 
495 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.381583  normal  0.0360554 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4396  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  27.86 
 
 
369 aa  87.8  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0133862  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4422  protein of unknown function DUF35  26.65 
 
 
474 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00766931  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2518  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  24.8 
 
 
412 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2608  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  24.8 
 
 
412 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1856  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  25.21 
 
 
484 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0653145  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2055  protein of unknown function DUF35  30.13 
 
 
474 aa  79.3  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0203372  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1583  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.27 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0414109  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2969  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  24.86 
 
 
397 aa  77.4  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  hitchhiker  0.0000211937 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8252  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26.51 
 
 
396 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112958  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1925  protein of unknown function DUF35  26.21 
 
 
474 aa  76.3  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4194  protein of unknown function DUF35  27.11 
 
 
473 aa  75.9  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492043  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2569  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26.03 
 
 
388 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2622  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26.03 
 
 
388 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2739  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  27.22 
 
 
326 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.12716  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2122  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  22.34 
 
 
388 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2750  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  25.86 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2842  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.86 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.61653  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1154  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25 
 
 
328 aa  74.3  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000934298  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0602  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.65 
 
 
319 aa  72.8  0.000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000174189  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0985  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.09 
 
 
318 aa  72  0.00000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2505  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.56 
 
 
317 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000055762  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2934  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.23 
 
 
326 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1585  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  27.94 
 
 
316 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421947  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1719  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  24.21 
 
 
389 aa  71.6  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.396765  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1666  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  25.77 
 
 
384 aa  71.6  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.696762  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.33 
 
 
339 aa  71.6  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.707185  normal  0.207521 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1136  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.22 
 
 
324 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.896107  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2141  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.27 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01750  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  28.3 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.425442 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2183  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.08 
 
 
329 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415325  normal  0.0499855 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1989  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  24.77 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1255  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.36 
 
 
310 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1293  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.36 
 
 
310 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1095  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.36 
 
 
310 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1077  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.36 
 
 
310 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1071  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.36 
 
 
310 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000173774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1184  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.36 
 
 
310 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1228  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.36 
 
 
310 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0031  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.26 
 
 
336 aa  69.3  0.00000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0645987  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1082  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.68 
 
 
310 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1332  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.04 
 
 
310 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.985696  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0744  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23.51 
 
 
328 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.968089  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0713  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  21.14 
 
 
331 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.36705 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4114  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.36 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1717  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.4 
 
 
329 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1669  Beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase I  23.26 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2810  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.94 
 
 
317 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3556  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  25.79 
 
 
319 aa  68.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.896137  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4233  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.09 
 
 
329 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338438  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6948  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  22.57 
 
 
332 aa  67.8  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.747585  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10544  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.92 
 
 
335 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.66749e-72  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5272  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.37 
 
 
325 aa  67  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1645  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.23 
 
 
344 aa  67  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1621  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.11 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000245792  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0401  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  28.99 
 
 
445 aa  66.6  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1372  3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA synthase  22.6 
 
 
387 aa  66.6  0.0000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.998569  hitchhiker  0.00000000102593 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2310  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  29.11 
 
 
445 aa  66.6  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.16 
 
 
321 aa  66.6  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.380869  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1079  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.15 
 
 
329 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.796482 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1121  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.15 
 
 
329 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2502  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  22.81 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0775365 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0666  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.2 
 
 
325 aa  66.2  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.52577  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2075  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  22.55 
 
 
335 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317439  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0641  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.15 
 
 
329 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1324  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.6 
 
 
324 aa  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.760998  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1215  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  22.77 
 
 
351 aa  65.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2766  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  23.27 
 
 
444 aa  65.5  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3280  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.75 
 
 
325 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.577877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>