114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2360 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2360  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  267  4e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.116484 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  38.1 
 
 		 143 aa  80.1  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  35.71 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  37.6 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  36.43 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  34.35 
 
 		 137 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  34.85 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  39.02 
 
 		 319 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  36 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  39.06 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  35.2 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  36.89 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  35.2 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  33.87 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  34.4 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  35.2 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  38.28 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  27.91 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  36.27 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  41.12 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  36.84 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  30.16 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  31.5 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  33.91 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  35.59 
 
 		 319 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  30.71 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  33.91 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  33.9 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  33.91 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  31.97 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  36.8 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  31.5 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  33.86 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  33.87 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  35 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  29.77 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  32 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  33.86 
 
 		 550 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  33.86 
 
 		 550 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  26.98 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  36.22 
 
 		 550 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  34.4 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000585754  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  33.08 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  31.97 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  35.43 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  31.9 
 
 		 541 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  31.2 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  31.11 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  31.97 
 
 		 139 aa  50.8  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  31.31 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  29.46 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  35.96 
 
 		 305 aa  50.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0060  protein of unknown function DUF35  26.67 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0436  protein of unknown function DUF35  27.88 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.686015  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  32.43 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000546433  hitchhiker  0.00000644081 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  29.1 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  32.76 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3932  protein of unknown function DUF35  29.73 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  34.43 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2094  hypothetical protein  43.14 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  30.51 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1972  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon-like protein  30.48 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1925  protein of unknown function DUF35  30.39 
 
 		 474 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4179  hypothetical protein  32.53 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  32.81 
 
 		 548 aa  47  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  30.97 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  30.97 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  34.13 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5281  hypothetical protein  30.65 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  30.77 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  31.07 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000923569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  28.7 
 
 		 152 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  32.08 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1497  protein of unknown function DUF35  38 
 
 		 417 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3255  putative short chain dehydrogenase  39.62 
 
 		 413 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  28.93 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  30.09 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  30.09 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  30.09 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  30.09 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  30.09 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  30.09 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  31.58 
 
 		 311 aa  44.7  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  30.58 
 
 		 176 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1310  hypothetical protein  30.77 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120998 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  27.45 
 
 		 177 aa  43.9  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3541  hypothetical protein  30.77 
 
 		 156 aa  43.5  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0915855 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  32.81 
 
 		 145 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  32.81 
 
 		 145 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  32.81 
 
 		 145 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0549  hypothetical protein  30.19 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0902  hypothetical protein  32.94 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2675  hypothetical protein  27.62 
 
 		 417 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  30.47 
 
 		 548 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  36 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  28.12 
 
 		 133 aa  42  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  27.27 
 
 		 140 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  29.37 
 
 		 312 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>