40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2808 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2808  protein of unknown function DUF35  100 
 
 
128 aa  259  1e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0884467  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1005  protein of unknown function DUF35  60.47 
 
 
133 aa  154  4e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.966695  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2476  protein of unknown function DUF35  57.26 
 
 
134 aa  147  5e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.73466  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0897  protein of unknown function DUF35  57.38 
 
 
131 aa  130  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3780  protein of unknown function DUF35  51.64 
 
 
126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000111928  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0598  protein of unknown function DUF35  47.2 
 
 
127 aa  123  7e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  29.46 
 
 
177 aa  57.4  0.00000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  32.97 
 
 
178 aa  51.6  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0155  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  51.6  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  32.11 
 
 
135 aa  52  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2508  protein of unknown function DUF35  32.32 
 
 
132 aa  50.8  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.347955  normal  0.395372 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  34.52 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  35.04 
 
 
145 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  35.04 
 
 
145 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  35.04 
 
 
145 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1241  hypothetical protein  36.23 
 
 
137 aa  47  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0148077  normal  0.0127741 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  32.93 
 
 
130 aa  46.2  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1934  hypothetical protein  29.17 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108502  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  27.5 
 
 
189 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  31.25 
 
 
130 aa  45.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  31.25 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0436  protein of unknown function DUF35  26.14 
 
 
128 aa  45.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.686015  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  30.3 
 
 
152 aa  44.7  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1310  hypothetical protein  27.12 
 
 
151 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120998 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  31.19 
 
 
145 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  34 
 
 
149 aa  43.5  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2582  hypothetical protein  32.23 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  0.0256768 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0549  hypothetical protein  34.52 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3818  protein of unknown function DUF35  32.71 
 
 
320 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.704476  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  30 
 
 
130 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  31.58 
 
 
129 aa  42  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  32.18 
 
 
142 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  31.48 
 
 
148 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3964  protein of unknown function DUF35  32.94 
 
 
329 aa  40.8  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  25.71 
 
 
137 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  32.53 
 
 
139 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0458  hypothetical protein  26.89 
 
 
182 aa  40.4  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  30.77 
 
 
143 aa  40.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  32.56 
 
 
141 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  26.67 
 
 
136 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0631046 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>