41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3624 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3624  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  304  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0940  hypothetical protein  53.52 
 
 		 153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8927  hypothetical protein  51.11 
 
 		 134 aa  137  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3014  hypothetical protein  46.15 
 
 		 146 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.764426  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3060  hypothetical protein  46.15 
 
 		 146 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.995907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3029  hypothetical protein  46.15 
 
 		 155 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.417482  normal  0.14022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3567  hypothetical protein  48.55 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11644  hypothetical protein  50 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.187499  normal  0.695339 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2863  hypothetical protein  46.67 
 
 		 172 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3365  hypothetical protein  46.67 
 
 		 172 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.810777  normal  0.110528 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3120  protein of unknown function DUF35  52.14 
 
 		 169 aa  94  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4526  hypothetical protein  47.06 
 
 		 143 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0992548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3555  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2520  hypothetical protein  28.68 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167569  normal  0.666068 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  29.46 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0812  hypothetical protein  32.8 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.553396  hitchhiker  0.000113363 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1630  hypothetical protein  35.8 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4138  hypothetical protein  28.12 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.342554 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4132  hypothetical protein  32.38 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479777  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1528  hypothetical protein  33.58 
 
 		 146 aa  47.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.467127 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  32.14 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3732  hypothetical protein  31.3 
 
 		 137 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3659  hypothetical protein  31.3 
 
 		 137 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17734  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0794  hypothetical protein  30.08 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1357  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3906  hypothetical protein  28.57 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0256992  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3388  hypothetical protein  28.68 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.809106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  30 
 
 		 130 aa  45.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  30.91 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  31.3 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  31.03 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3672  hypothetical protein  29.1 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.108807  normal  0.573153 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  29.17 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  28 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1241  hypothetical protein  30.4 
 
 		 137 aa  42  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0148077  normal  0.0127741 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4111  hypothetical protein  28.57 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0961571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  28.18 
 
 		 130 aa  41.2  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  31.03 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0149  hypothetical protein  28.32 
 
 		 129 aa  40.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>