41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4526 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4526  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  294  3e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0992548  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3567  hypothetical protein  89.44 
 
 
145 aa  238  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3014  hypothetical protein  81.29 
 
 
146 aa  211  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.764426  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3060  hypothetical protein  81.29 
 
 
146 aa  211  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.995907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3029  hypothetical protein  80.14 
 
 
155 aa  210  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.417482  normal  0.14022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3365  hypothetical protein  83.97 
 
 
172 aa  204  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.810777  normal  0.110528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2863  hypothetical protein  83.97 
 
 
172 aa  204  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580018  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11644  hypothetical protein  75.18 
 
 
163 aa  189  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.187499  normal  0.695339 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0940  hypothetical protein  50.35 
 
 
153 aa  124  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3624  hypothetical protein  47.06 
 
 
149 aa  122  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8927  hypothetical protein  47.86 
 
 
134 aa  110  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3120  protein of unknown function DUF35  51.06 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4138  hypothetical protein  34.78 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.342554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3906  hypothetical protein  34.13 
 
 
143 aa  67  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0256992  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3659  hypothetical protein  36.89 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17734  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3732  hypothetical protein  36.89 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2520  hypothetical protein  36.07 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167569  normal  0.666068 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3672  hypothetical protein  36.51 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.108807  normal  0.573153 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3555  hypothetical protein  41.82 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4132  hypothetical protein  33.61 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479777  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3388  hypothetical protein  33.61 
 
 
138 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.809106  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  30.83 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17870  predicted nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  41.46 
 
 
141 aa  48.9  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.736361  normal  0.638502 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  28.79 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  30 
 
 
137 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  30.43 
 
 
148 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  31.09 
 
 
135 aa  45.1  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  33.91 
 
 
134 aa  44.3  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  32.46 
 
 
155 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  30 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  34.48 
 
 
176 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  29.75 
 
 
137 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  30.83 
 
 
137 aa  43.5  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  27.54 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  28.03 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4111  hypothetical protein  33.79 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0961571  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1310  hypothetical protein  31.63 
 
 
151 aa  42  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120998 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  28.07 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1528  hypothetical protein  39.62 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.467127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  33.33 
 
 
136 aa  40.4  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0631046 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  27.18 
 
 
178 aa  40  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>