59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2520 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2520  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  297  3e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167569  normal  0.666068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4138  hypothetical protein  89.04 
 
 
146 aa  272  9e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.342554 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3732  hypothetical protein  84.44 
 
 
137 aa  239  7e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3659  hypothetical protein  84.44 
 
 
137 aa  239  7e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17734  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3672  hypothetical protein  82.73 
 
 
141 aa  234  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.108807  normal  0.573153 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3388  hypothetical protein  72.26 
 
 
138 aa  207  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.809106  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3906  hypothetical protein  52.9 
 
 
143 aa  149  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0256992  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4132  hypothetical protein  48.33 
 
 
149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479777  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3365  hypothetical protein  35.66 
 
 
172 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.810777  normal  0.110528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2863  hypothetical protein  37.6 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580018  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3029  hypothetical protein  32.88 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.417482  normal  0.14022 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3060  hypothetical protein  32.87 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.995907 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3014  hypothetical protein  32.87 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.764426  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1357  hypothetical protein  32.8 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0794  hypothetical protein  32.26 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  33.96 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0940  hypothetical protein  30 
 
 
153 aa  61.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0812  hypothetical protein  31.2 
 
 
134 aa  60.8  0.000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.553396  hitchhiker  0.000113363 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8927  hypothetical protein  32.79 
 
 
134 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3555  hypothetical protein  35.77 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1083  hypothetical protein  30.95 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3587  hypothetical protein  35.71 
 
 
133 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645775  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3567  hypothetical protein  33.1 
 
 
145 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  24.81 
 
 
130 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11644  hypothetical protein  32 
 
 
163 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.187499  normal  0.695339 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  27.41 
 
 
130 aa  53.9  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  30 
 
 
189 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3624  hypothetical protein  28.68 
 
 
149 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17870  predicted nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  38.78 
 
 
141 aa  52.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.736361  normal  0.638502 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  30.1 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4111  hypothetical protein  35.66 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0961571  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  27.21 
 
 
130 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1310  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  51.2  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120998 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0458  hypothetical protein  27.73 
 
 
182 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4526  hypothetical protein  31.94 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0992548  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  27.21 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  24.75 
 
 
178 aa  50.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  27.21 
 
 
129 aa  50.1  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  24.53 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2840  protein of unknown function DUF35  31.3 
 
 
132 aa  48.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00189293  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3255  putative short chain dehydrogenase  25.47 
 
 
413 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal  0.516031 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1609  protein of unknown function DUF35  26.17 
 
 
133 aa  47.8  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1528  hypothetical protein  26.67 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.467127 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1438  3-hydroxybutyryl-CoA epimerase  29 
 
 
576 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.410853  normal  0.0151032 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1648  hypothetical protein  27.05 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2476  protein of unknown function DUF35  27.78 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.73466  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  25.74 
 
 
315 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  23.14 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  26.96 
 
 
143 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  29.91 
 
 
140 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  29.7 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  25 
 
 
136 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  26.26 
 
 
131 aa  43.9  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  25.78 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6745  hypothetical protein  33.33 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00221368  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  25.6 
 
 
140 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  28.71 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  24.76 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0885  protein of unknown function DUF35  33.87 
 
 
333 aa  40.4  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>