49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3567 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3567  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  298  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3014  hypothetical protein  81.25 
 
 
146 aa  221  4e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.764426  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3060  hypothetical protein  81.25 
 
 
146 aa  221  4e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.995907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3029  hypothetical protein  81.82 
 
 
155 aa  220  6e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.417482  normal  0.14022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4526  hypothetical protein  89.44 
 
 
143 aa  219  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0992548  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3365  hypothetical protein  69.19 
 
 
172 aa  211  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.810777  normal  0.110528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2863  hypothetical protein  68.6 
 
 
172 aa  208  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580018  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11644  hypothetical protein  78.26 
 
 
163 aa  197  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.187499  normal  0.695339 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0940  hypothetical protein  51.37 
 
 
153 aa  133  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3624  hypothetical protein  48.55 
 
 
149 aa  128  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8927  hypothetical protein  52.99 
 
 
134 aa  122  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3120  protein of unknown function DUF35  52.48 
 
 
169 aa  82.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3555  hypothetical protein  40.74 
 
 
132 aa  72  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3906  hypothetical protein  34.15 
 
 
143 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0256992  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4138  hypothetical protein  37.4 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.342554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3388  hypothetical protein  32.64 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.809106  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2520  hypothetical protein  35.77 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167569  normal  0.666068 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3732  hypothetical protein  31.94 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3659  hypothetical protein  31.94 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17734  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3672  hypothetical protein  31.97 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.108807  normal  0.573153 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4132  hypothetical protein  29.93 
 
 
149 aa  60.8  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479777  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17870  predicted nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  42.68 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.736361  normal  0.638502 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  33.93 
 
 
155 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  33.94 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  33.71 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  29.77 
 
 
137 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  30.93 
 
 
137 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1528  hypothetical protein  41.51 
 
 
146 aa  44.3  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.467127 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  27.69 
 
 
129 aa  44.3  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0387  hypothetical protein  33.7 
 
 
129 aa  44.3  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.448785  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  27.54 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  28.57 
 
 
130 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  35 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  42.11 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  34.62 
 
 
319 aa  42.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  28.46 
 
 
137 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  28.57 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  30.63 
 
 
541 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  29.77 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  28.24 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  29.81 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4111  hypothetical protein  32.12 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0961571  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  30.99 
 
 
132 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  28.06 
 
 
137 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  29.51 
 
 
137 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  30.08 
 
 
130 aa  41.2  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  27.36 
 
 
178 aa  41.6  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  34.29 
 
 
135 aa  40.8  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  30.63 
 
 
133 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>