38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4111 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4111  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  281  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0961571  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3906  hypothetical protein  35.34 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0256992  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3555  hypothetical protein  36.96 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2520  hypothetical protein  35.66 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167569  normal  0.666068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4138  hypothetical protein  35.66 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.342554 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3659  hypothetical protein  34.11 
 
 
137 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17734  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3732  hypothetical protein  34.11 
 
 
137 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3388  hypothetical protein  39.76 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.809106  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0940  hypothetical protein  30.82 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3672  hypothetical protein  33.83 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.108807  normal  0.573153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8927  hypothetical protein  31.09 
 
 
134 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3624  hypothetical protein  28.87 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3871  hypothetical protein  28.89 
 
 
131 aa  53.9  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17870  predicted nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  36 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.736361  normal  0.638502 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  27.41 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3587  hypothetical protein  37.11 
 
 
133 aa  47  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645775  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  35.21 
 
 
319 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4132  hypothetical protein  28.38 
 
 
149 aa  47  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479777  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1145  protein of unknown function DUF35  33.08 
 
 
133 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0574924  hitchhiker  0.0000746026 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4760  hypothetical protein  27.27 
 
 
318 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247642  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  25 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4674  hypothetical protein  27.27 
 
 
318 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3014  hypothetical protein  32.62 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.764426  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  30.34 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3029  hypothetical protein  32.62 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.417482  normal  0.14022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5255  hypothetical protein  27.27 
 
 
324 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3060  hypothetical protein  32.62 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.995907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  32.58 
 
 
141 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  32.88 
 
 
319 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  24.81 
 
 
134 aa  42  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0428  hypothetical protein  30.6 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0261769  normal  0.146814 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  24.24 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5059  hypothetical protein  26.52 
 
 
317 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.945383  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  33.33 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  28.46 
 
 
129 aa  40.4  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  29.89 
 
 
127 aa  40.4  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  29.89 
 
 
127 aa  40  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4154  hypothetical protein  31.68 
 
 
397 aa  40  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.880245  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>