34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3871 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3871  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  276  9e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1145  protein of unknown function DUF35  50 
 
 
133 aa  134  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0574924  hitchhiker  0.0000746026 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0428  hypothetical protein  47.33 
 
 
131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0261769  normal  0.146814 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0984  hypothetical protein  46.92 
 
 
132 aa  124  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  78.2  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  32.56 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  33.33 
 
 
129 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  30.47 
 
 
135 aa  73.9  0.0000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  34.11 
 
 
130 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  31.78 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  31.3 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0812  hypothetical protein  30.71 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.553396  hitchhiker  0.000113363 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0549  hypothetical protein  29.01 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1357  hypothetical protein  30.71 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0794  hypothetical protein  29.92 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1625  hypothetical protein  28.24 
 
 
130 aa  61.6  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1241  hypothetical protein  30.23 
 
 
137 aa  60.1  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0148077  normal  0.0127741 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1083  hypothetical protein  31.5 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2508  protein of unknown function DUF35  29.46 
 
 
132 aa  58.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.347955  normal  0.395372 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  29.69 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1934  hypothetical protein  25.58 
 
 
133 aa  55.5  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108502  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0149  hypothetical protein  27.07 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  25.56 
 
 
130 aa  51.6  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1648  hypothetical protein  32.54 
 
 
135 aa  51.6  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1609  protein of unknown function DUF35  26.61 
 
 
133 aa  51.2  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  33.03 
 
 
143 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0155  hypothetical protein  24.06 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4760  hypothetical protein  27.17 
 
 
318 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247642  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4674  hypothetical protein  27.17 
 
 
318 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5059  hypothetical protein  27.17 
 
 
317 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.945383  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1438  3-hydroxybutyryl-CoA epimerase  32.94 
 
 
576 aa  42  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.410853  normal  0.0151032 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3555  hypothetical protein  24.35 
 
 
132 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3906  hypothetical protein  26.12 
 
 
143 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0256992  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  27.52 
 
 
319 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>