60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3587 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3587  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  265  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645775  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17870  predicted nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  50 
 
 		 141 aa  90.5  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.736361  normal  0.638502 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4132  hypothetical protein  46.88 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479777  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3906  hypothetical protein  42.16 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0256992  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3388  hypothetical protein  40.74 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.809106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3659  hypothetical protein  39.8 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17734  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3732  hypothetical protein  39.8 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3672  hypothetical protein  37.25 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.108807  normal  0.573153 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  38.95 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2520  hypothetical protein  35.71 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167569  normal  0.666068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4138  hypothetical protein  35.71 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.342554 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  36.84 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3555  hypothetical protein  40.18 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  35.79 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  36.79 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  32.32 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  33.33 
 
 		 319 aa  53.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0940  hypothetical protein  40.96 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0458  hypothetical protein  32.32 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  29.41 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  36.08 
 
 		 315 aa  50.4  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  29.29 
 
 		 189 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  37.76 
 
 		 319 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1438  3-hydroxybutyryl-CoA epimerase  29.41 
 
 		 576 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.410853  normal  0.0151032 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1625  hypothetical protein  31 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  35.85 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  37.11 
 
 		 305 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  32.65 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  28.57 
 
 		 139 aa  47.8  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  30.39 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0149  hypothetical protein  31.31 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1609  protein of unknown function DUF35  28.57 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1934  hypothetical protein  30.93 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108502  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13575  hypothetical protein  47.46 
 
 		 311 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328171 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  32.67 
 
 		 321 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0549  hypothetical protein  29.29 
 
 		 132 aa  44.3  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0436  protein of unknown function DUF35  27.27 
 
 		 128 aa  43.5  0.0009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.686015  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3567  hypothetical protein  32.26 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4111  hypothetical protein  37.62 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0961571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  29.82 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5059  hypothetical protein  42.37 
 
 		 317 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.945383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5255  hypothetical protein  40.68 
 
 		 324 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4674  hypothetical protein  42.37 
 
 		 318 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1511  hypothetical protein  44.07 
 
 		 317 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4760  hypothetical protein  42.37 
 
 		 318 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4020  hypothetical protein  30.39 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.909625 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  28.43 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  27.72 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  30 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0885  protein of unknown function DUF35  44.07 
 
 		 333 aa  40.8  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3856  protein of unknown function DUF35  48.21 
 
 		 322 aa  40.8  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.343505  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  29.36 
 
 		 130 aa  40.4  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  28.43 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  27.37 
 
 		 132 aa  40.4  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  22.12 
 
 		 178 aa  40.8  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3365  hypothetical protein  33.61 
 
 		 172 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.810777  normal  0.110528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2863  hypothetical protein  33.61 
 
 		 172 aa  40.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580018  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>