39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3365 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3365  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  350  4e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.810777  normal  0.110528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2863  hypothetical protein  97.67 
 
 
172 aa  318  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580018  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3029  hypothetical protein  75.29 
 
 
155 aa  234  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.417482  normal  0.14022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3014  hypothetical protein  74.85 
 
 
146 aa  234  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.764426  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3060  hypothetical protein  74.85 
 
 
146 aa  234  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.995907 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3567  hypothetical protein  69.19 
 
 
145 aa  214  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11644  hypothetical protein  66.67 
 
 
163 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.187499  normal  0.695339 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4526  hypothetical protein  83.97 
 
 
143 aa  188  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0992548  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0940  hypothetical protein  43.35 
 
 
153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3624  hypothetical protein  46.67 
 
 
149 aa  116  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8927  hypothetical protein  42.67 
 
 
134 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4138  hypothetical protein  41.6 
 
 
146 aa  85.1  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.342554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3906  hypothetical protein  37.41 
 
 
143 aa  83.6  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0256992  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4132  hypothetical protein  36.59 
 
 
149 aa  80.5  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479777  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2520  hypothetical protein  39.2 
 
 
146 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167569  normal  0.666068 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3388  hypothetical protein  37.9 
 
 
138 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.809106  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3555  hypothetical protein  43.2 
 
 
132 aa  77.4  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3672  hypothetical protein  36.72 
 
 
141 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.108807  normal  0.573153 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3659  hypothetical protein  37.6 
 
 
137 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17734  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3732  hypothetical protein  37.6 
 
 
137 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3120  protein of unknown function DUF35  42.86 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17870  predicted nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  43.53 
 
 
141 aa  54.7  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.736361  normal  0.638502 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  36 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  33.88 
 
 
137 aa  47.4  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1528  hypothetical protein  30.65 
 
 
146 aa  45.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.467127 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  34.21 
 
 
137 aa  45.1  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  30.95 
 
 
130 aa  44.7  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  35.64 
 
 
140 aa  44.7  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  30.95 
 
 
130 aa  44.3  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  37.18 
 
 
135 aa  44.3  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  30.16 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  30.08 
 
 
129 aa  43.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  31.67 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  36.11 
 
 
319 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  30 
 
 
133 aa  42.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1609  protein of unknown function DUF35  28.35 
 
 
133 aa  42  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  41.2  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  25.45 
 
 
178 aa  40.8  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>