51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11644 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11644  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  333  5e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.187499  normal  0.695339 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3029  hypothetical protein  79.87 
 
 
155 aa  223  9e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.417482  normal  0.14022 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3060  hypothetical protein  84.06 
 
 
146 aa  221  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.995907 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3014  hypothetical protein  84.06 
 
 
146 aa  221  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.764426  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3567  hypothetical protein  78.26 
 
 
145 aa  206  9e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2863  hypothetical protein  66.07 
 
 
172 aa  202  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580018  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3365  hypothetical protein  66.67 
 
 
172 aa  202  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.810777  normal  0.110528 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4526  hypothetical protein  75.18 
 
 
143 aa  178  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0992548  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0940  hypothetical protein  50.33 
 
 
153 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3624  hypothetical protein  50 
 
 
149 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8927  hypothetical protein  52.07 
 
 
134 aa  121  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3906  hypothetical protein  34.53 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0256992  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4132  hypothetical protein  32.09 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479777  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3555  hypothetical protein  42.28 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4138  hypothetical protein  34.06 
 
 
146 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.342554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3120  protein of unknown function DUF35  48.92 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2520  hypothetical protein  33.6 
 
 
146 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167569  normal  0.666068 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3388  hypothetical protein  32.8 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.809106  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3672  hypothetical protein  32.81 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.108807  normal  0.573153 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3659  hypothetical protein  32.8 
 
 
137 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17734  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3732  hypothetical protein  32.8 
 
 
137 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.315586 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  29.81 
 
 
178 aa  48.9  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  44.07 
 
 
134 aa  48.5  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  37 
 
 
135 aa  47.8  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  30.83 
 
 
148 aa  47.8  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17870  predicted nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  35 
 
 
141 aa  47  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.736361  normal  0.638502 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  32.54 
 
 
130 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  31.75 
 
 
130 aa  46.6  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  31.11 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  32.14 
 
 
319 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  30.95 
 
 
130 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  28.69 
 
 
130 aa  44.3  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  32 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  36 
 
 
137 aa  43.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0436  protein of unknown function DUF35  26.21 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.686015  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1609  protein of unknown function DUF35  30.36 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  33.33 
 
 
319 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0387  hypothetical protein  30 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.448785  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  27.78 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  30.4 
 
 
129 aa  42.4  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1528  hypothetical protein  29.37 
 
 
146 aa  42.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.467127 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  30.97 
 
 
132 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  31.58 
 
 
137 aa  42  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  32.14 
 
 
136 aa  42  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  31.01 
 
 
137 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  29.82 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1241  hypothetical protein  32.46 
 
 
137 aa  41.6  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0148077  normal  0.0127741 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  33.98 
 
 
155 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  30.14 
 
 
137 aa  41.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  30.08 
 
 
152 aa  40.8  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1630  hypothetical protein  31.48 
 
 
128 aa  40.8  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>