46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3120 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3120  protein of unknown function DUF35  100 
 
 		 169 aa  336  7e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3624  hypothetical protein  52.14 
 
 		 149 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3567  hypothetical protein  52.48 
 
 		 145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3014  hypothetical protein  48.94 
 
 		 146 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.764426  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0940  hypothetical protein  45.77 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3060  hypothetical protein  48.94 
 
 		 146 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.995907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3029  hypothetical protein  48.94 
 
 		 155 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.417482  normal  0.14022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2863  hypothetical protein  42.94 
 
 		 172 aa  97.1  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3365  hypothetical protein  42.86 
 
 		 172 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.810777  normal  0.110528 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11644  hypothetical protein  48.92 
 
 		 163 aa  90.9  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.187499  normal  0.695339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8927  hypothetical protein  45.97 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4526  hypothetical protein  48.28 
 
 		 143 aa  88.2  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0992548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3906  hypothetical protein  33.6 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0256992  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3659  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17734  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3732  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4132  hypothetical protein  33.68 
 
 		 149 aa  50.8  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479777  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1925  protein of unknown function DUF35  32.61 
 
 		 474 aa  50.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0060  protein of unknown function DUF35  34.65 
 
 		 136 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3555  hypothetical protein  40.17 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2520  hypothetical protein  32.5 
 
 		 146 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167569  normal  0.666068 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  35.07 
 
 		 137 aa  47.8  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  32.56 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3672  hypothetical protein  32.71 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.108807  normal  0.573153 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  32.81 
 
 		 132 aa  47.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  25.55 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4138  hypothetical protein  32.69 
 
 		 146 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.342554 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0597  protein of unknown function DUF35  29.86 
 
 		 490 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  31.15 
 
 		 319 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  30.56 
 
 		 129 aa  45.4  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  28.7 
 
 		 130 aa  45.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  29.63 
 
 		 130 aa  45.1  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  33.33 
 
 		 319 aa  44.7  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  34.71 
 
 		 137 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  30.91 
 
 		 134 aa  44.7  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  33.63 
 
 		 137 aa  44.3  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  34.78 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  28.7 
 
 		 130 aa  43.5  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  31.19 
 
 		 130 aa  43.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  30.91 
 
 		 152 aa  42.4  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4021  protein of unknown function DUF35  27.74 
 
 		 481 aa  42.4  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.605764  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  35.37 
 
 		 130 aa  41.2  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4111  hypothetical protein  34.97 
 
 		 142 aa  41.2  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0961571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  31.58 
 
 		 135 aa  41.2  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  34.17 
 
 		 137 aa  41.2  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  36.63 
 
 		 141 aa  40.4  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>