54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8927 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8927  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  273  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3624  hypothetical protein  51.11 
 
 		 149 aa  137  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0940  hypothetical protein  57.98 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3029  hypothetical protein  53.66 
 
 		 155 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.417482  normal  0.14022 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3060  hypothetical protein  53.66 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.995907 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3014  hypothetical protein  53.66 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.764426  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3567  hypothetical protein  52.99 
 
 		 145 aa  110  9e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11644  hypothetical protein  52.07 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.187499  normal  0.695339 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3365  hypothetical protein  42.67 
 
 		 172 aa  100  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.810777  normal  0.110528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2863  hypothetical protein  42.57 
 
 		 172 aa  99.4  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4526  hypothetical protein  47.86 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0992548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3388  hypothetical protein  33.09 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.809106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2520  hypothetical protein  32.79 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167569  normal  0.666068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3120  protein of unknown function DUF35  45.16 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3555  hypothetical protein  36.13 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  31.67 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4132  hypothetical protein  33.06 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479777  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3659  hypothetical protein  31.97 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17734  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3672  hypothetical protein  31.2 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.108807  normal  0.573153 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4138  hypothetical protein  32.79 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.342554 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3732  hypothetical protein  31.97 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3906  hypothetical protein  30.56 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0256992  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  30.56 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  29.75 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  30.58 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  31.67 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  28.7 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  33.61 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  28.93 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  33.04 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  30.91 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  35.58 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  37.07 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  35.24 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  31.37 
 
 		 135 aa  47  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  30 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  31.62 
 
 		 319 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  31.58 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  31.67 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  34.62 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  30.83 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0812  hypothetical protein  30.69 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.553396  hitchhiker  0.000113363 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0794  hypothetical protein  30.17 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  33.63 
 
 		 137 aa  43.5  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  25.66 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4111  hypothetical protein  31.09 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0961571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  30.63 
 
 		 319 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  27.78 
 
 		 133 aa  41.2  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  38.18 
 
 		 177 aa  41.2  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2582  hypothetical protein  28.24 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  0.0256768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  30.77 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  30.1 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  29.59 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  31.07 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>