45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1630 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1630  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  264  2.9999999999999995e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0436  protein of unknown function DUF35  26.6 
 
 
128 aa  54.3  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.686015  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  31.91 
 
 
130 aa  53.5  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  30.85 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  35.29 
 
 
130 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  32.65 
 
 
141 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2476  protein of unknown function DUF35  32.94 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.73466  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1241  hypothetical protein  32.56 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0148077  normal  0.0127741 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  35.29 
 
 
129 aa  50.1  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  37.31 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  24.07 
 
 
177 aa  48.5  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3624  hypothetical protein  35.8 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  27.36 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0387  hypothetical protein  28.21 
 
 
129 aa  47.8  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.448785  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  36.11 
 
 
136 aa  47.4  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  28.87 
 
 
137 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0149  hypothetical protein  30.49 
 
 
129 aa  47  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  28.38 
 
 
178 aa  46.6  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  28.87 
 
 
137 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0549  hypothetical protein  38.1 
 
 
132 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  25.61 
 
 
143 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  24.3 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  28.17 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0060  protein of unknown function DUF35  33.75 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  31.11 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000546433  hitchhiker  0.00000644081 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  31.48 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  26.26 
 
 
120 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  29.25 
 
 
132 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  26.73 
 
 
134 aa  44.7  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0794  hypothetical protein  32 
 
 
133 aa  44.3  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  31.71 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  33.33 
 
 
133 aa  43.9  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  28.04 
 
 
148 aa  43.5  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1438  3-hydroxybutyryl-CoA epimerase  24.76 
 
 
576 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.410853  normal  0.0151032 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2508  protein of unknown function DUF35  30.43 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.347955  normal  0.395372 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1609  protein of unknown function DUF35  28.57 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  29.59 
 
 
319 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0458  hypothetical protein  24.68 
 
 
182 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1934  hypothetical protein  29.27 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108502  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2642  hypothetical protein  26.88 
 
 
329 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13056  normal  0.212134 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  25.53 
 
 
305 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  33.96 
 
 
133 aa  40.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1083  hypothetical protein  30.34 
 
 
134 aa  40.4  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  27.52 
 
 
152 aa  40.4  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2839  hypothetical protein  24.73 
 
 
319 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11529  normal  0.0470778 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>