31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2839 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2839  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  639    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11529  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2642  hypothetical protein  88.12 
 
 
329 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13056  normal  0.212134 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3818  protein of unknown function DUF35  61.98 
 
 
320 aa  392  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.704476  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2732  hypothetical protein  61.27 
 
 
319 aa  387  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5016  hypothetical protein  55.59 
 
 
338 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13554  hypothetical protein  55.97 
 
 
334 aa  350  2e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150735 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4634  hypothetical protein  54.97 
 
 
338 aa  349  3e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4722  hypothetical protein  54.97 
 
 
338 aa  349  3e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5220  hypothetical protein  54.92 
 
 
330 aa  343  2e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146278  normal  0.27671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1538  hypothetical protein  55.21 
 
 
332 aa  336  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3964  protein of unknown function DUF35  53.14 
 
 
329 aa  311  6.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3983  protein of unknown function DUF35  48.48 
 
 
309 aa  280  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.411104  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3090  protein of unknown function DUF35  47.94 
 
 
335 aa  276  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1482  nucleic-acid-binding protein containing a Zn- ribbon-like protein  48.37 
 
 
295 aa  256  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2783  protein of unknown function DUF35  30.5 
 
 
165 aa  68.6  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.103009  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0269  hypothetical protein  33.55 
 
 
165 aa  67.8  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000709024  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0268  hypothetical protein  30.3 
 
 
141 aa  61.2  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00125281  normal  0.120379 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3784  protein of unknown function DUF35  28.22 
 
 
165 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.0099748  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  36.36 
 
 
134 aa  52.8  0.000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  36.08 
 
 
135 aa  52.4  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  33.64 
 
 
148 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  26.85 
 
 
178 aa  48.1  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2784  protein of unknown function DUF35  25.89 
 
 
144 aa  47.8  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0211194  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  35 
 
 
139 aa  46.6  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0149  hypothetical protein  33.66 
 
 
129 aa  46.6  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2762  hypothetical protein  27.37 
 
 
158 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.10983  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1005  protein of unknown function DUF35  36.27 
 
 
133 aa  43.9  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.966695  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  33.1 
 
 
141 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2508  protein of unknown function DUF35  33.33 
 
 
132 aa  43.1  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.347955  normal  0.395372 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  26.27 
 
 
130 aa  42.7  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  32.32 
 
 
135 aa  42.7  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.367067 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>