38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2762 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2762  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  326  8e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.10983  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3784  protein of unknown function DUF35  26.09 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.0099748  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4722  hypothetical protein  33.79 
 
 		 338 aa  70.9  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4634  hypothetical protein  33.79 
 
 		 338 aa  70.9  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2784  protein of unknown function DUF35  30.08 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0211194  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5016  hypothetical protein  33.1 
 
 		 338 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5220  hypothetical protein  28.97 
 
 		 330 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146278  normal  0.27671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3090  protein of unknown function DUF35  31.45 
 
 		 335 aa  60.8  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1538  hypothetical protein  31.51 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2732  hypothetical protein  33.9 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1482  nucleic-acid-binding protein containing a Zn- ribbon-like protein  33.8 
 
 		 295 aa  58.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  29.38 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3818  protein of unknown function DUF35  28.38 
 
 		 320 aa  53.9  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.704476  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0268  hypothetical protein  30.3 
 
 		 141 aa  53.9  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00125281  normal  0.120379 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13554  hypothetical protein  30.83 
 
 		 334 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150735 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  29.27 
 
 		 130 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0269  hypothetical protein  29.21 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000709024  normal  0.121609 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  26.38 
 
 		 178 aa  47.8  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3983  protein of unknown function DUF35  26.4 
 
 		 309 aa  47.8  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.411104  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  29.27 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  28.99 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2642  hypothetical protein  25.76 
 
 		 329 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13056  normal  0.212134 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2783  protein of unknown function DUF35  26.97 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.103009  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  31.36 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  25.19 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  31.19 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  31.3 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  32.48 
 
 		 148 aa  44.3  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2839  hypothetical protein  27.37 
 
 		 319 aa  44.3  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11529  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  31.76 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  25.45 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1310  hypothetical protein  35.05 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120998 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  25.45 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  29.57 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  35.37 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  25.45 
 
 		 137 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  30.77 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  26.27 
 
 		 137 aa  41.2  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>