37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0268 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0268  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  285  1e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00125281  normal  0.120379 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2784  protein of unknown function DUF35  49.65 
 
 		 144 aa  157  5e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0211194  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0269  hypothetical protein  55.56 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000709024  normal  0.121609 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2783  protein of unknown function DUF35  46.51 
 
 		 165 aa  85.9  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.103009  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2732  hypothetical protein  34 
 
 		 319 aa  70.5  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  34.65 
 
 		 178 aa  63.9  0.0000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2839  hypothetical protein  30.3 
 
 		 319 aa  61.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11529  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2642  hypothetical protein  34.69 
 
 		 329 aa  61.6  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13056  normal  0.212134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3090  protein of unknown function DUF35  33.33 
 
 		 335 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3983  protein of unknown function DUF35  34.95 
 
 		 309 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.411104  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0387  hypothetical protein  28.83 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.448785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2762  hypothetical protein  30.3 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.10983  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3818  protein of unknown function DUF35  31.82 
 
 		 320 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.704476  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3784  protein of unknown function DUF35  25.25 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.0099748  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1482  nucleic-acid-binding protein containing a Zn- ribbon-like protein  32.67 
 
 		 295 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  31.91 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1310  hypothetical protein  34.62 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120998 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1438  3-hydroxybutyryl-CoA epimerase  31.91 
 
 		 576 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.410853  normal  0.0151032 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0436  protein of unknown function DUF35  25 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.686015  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0458  hypothetical protein  32.29 
 
 		 182 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4634  hypothetical protein  30.63 
 
 		 338 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4722  hypothetical protein  30.63 
 
 		 338 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5016  hypothetical protein  30.63 
 
 		 338 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5220  hypothetical protein  31.96 
 
 		 330 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146278  normal  0.27671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1538  hypothetical protein  29.9 
 
 		 332 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1083  hypothetical protein  30.86 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  31.75 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0155  hypothetical protein  32.05 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0812  hypothetical protein  30.43 
 
 		 134 aa  42  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.553396  hitchhiker  0.000113363 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  27.27 
 
 		 130 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  25.2 
 
 		 143 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  28.33 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  28.07 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1609  protein of unknown function DUF35  30.3 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13554  hypothetical protein  24.32 
 
 		 334 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150735 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  27.68 
 
 		 132 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000585754  normal  0.649702 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>