30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3983 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3983  protein of unknown function DUF35  100 
 
 		 309 aa  622  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.411104  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1482  nucleic-acid-binding protein containing a Zn- ribbon-like protein  66.56 
 
 		 295 aa  398  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3090  protein of unknown function DUF35  57.59 
 
 		 335 aa  362  3e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2732  hypothetical protein  50.16 
 
 		 319 aa  299  4e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2642  hypothetical protein  49.69 
 
 		 329 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13056  normal  0.212134 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2839  hypothetical protein  49.37 
 
 		 319 aa  279  4e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11529  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3818  protein of unknown function DUF35  47.27 
 
 		 320 aa  272  5.000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.704476  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13554  hypothetical protein  46.33 
 
 		 334 aa  251  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150735 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5220  hypothetical protein  45.43 
 
 		 330 aa  251  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146278  normal  0.27671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5016  hypothetical protein  45.54 
 
 		 338 aa  241  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1538  hypothetical protein  44.79 
 
 		 332 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4722  hypothetical protein  44.62 
 
 		 338 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4634  hypothetical protein  44.62 
 
 		 338 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3964  protein of unknown function DUF35  42.59 
 
 		 329 aa  229  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2783  protein of unknown function DUF35  34.44 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.103009  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0269  hypothetical protein  28.66 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000709024  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0268  hypothetical protein  34.95 
 
 		 141 aa  54.7  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00125281  normal  0.120379 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  26.92 
 
 		 178 aa  53.5  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3784  protein of unknown function DUF35  28.57 
 
 		 165 aa  52.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.0099748  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  26.19 
 
 		 141 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  33.04 
 
 		 131 aa  51.2  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  27.19 
 
 		 177 aa  48.5  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  31.07 
 
 		 135 aa  48.1  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  31.48 
 
 		 132 aa  47.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2762  hypothetical protein  26.4 
 
 		 158 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.10983  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  29.41 
 
 		 135 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  27.78 
 
 		 148 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  28 
 
 		 141 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000546433  hitchhiker  0.00000644081 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  26.92 
 
 		 136 aa  43.5  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  28.18 
 
 		 142 aa  43.5  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>