41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2642 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2642  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  657    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13056  normal  0.212134 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2839  hypothetical protein  88.93 
 
 		 319 aa  547  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11529  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3818  protein of unknown function DUF35  61.98 
 
 		 320 aa  393  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.704476  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2732  hypothetical protein  60.25 
 
 		 319 aa  384  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13554  hypothetical protein  56.39 
 
 		 334 aa  354  1e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150735 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5016  hypothetical protein  55.73 
 
 		 338 aa  351  8e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4634  hypothetical protein  55.11 
 
 		 338 aa  347  1e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4722  hypothetical protein  55.11 
 
 		 338 aa  347  1e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5220  hypothetical protein  54.23 
 
 		 330 aa  343  2e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146278  normal  0.27671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1538  hypothetical protein  53.44 
 
 		 332 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3964  protein of unknown function DUF35  53.89 
 
 		 329 aa  319  5e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3090  protein of unknown function DUF35  50.16 
 
 		 335 aa  285  9e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3983  protein of unknown function DUF35  49.69 
 
 		 309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.411104  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1482  nucleic-acid-binding protein containing a Zn- ribbon-like protein  49.67 
 
 		 295 aa  259  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2783  protein of unknown function DUF35  28.37 
 
 		 165 aa  67  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.103009  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0269  hypothetical protein  31.43 
 
 		 165 aa  64.3  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000709024  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0268  hypothetical protein  34.69 
 
 		 141 aa  61.6  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00125281  normal  0.120379 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  39.18 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3784  protein of unknown function DUF35  26.53 
 
 		 165 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.0099748  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  34.34 
 
 		 134 aa  50.4  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  35.45 
 
 		 148 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1005  protein of unknown function DUF35  35.2 
 
 		 133 aa  48.9  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.966695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  34.91 
 
 		 139 aa  48.9  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0155  hypothetical protein  28.07 
 
 		 130 aa  47  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2762  hypothetical protein  25.76 
 
 		 158 aa  46.6  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.10983  normal  0.416635 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  28.45 
 
 		 178 aa  45.8  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  27.34 
 
 		 177 aa  45.4  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  32.67 
 
 		 135 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  30.36 
 
 		 189 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2784  protein of unknown function DUF35  23.01 
 
 		 144 aa  43.9  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0211194  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  31.93 
 
 		 133 aa  43.9  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  33.33 
 
 		 120 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  28.29 
 
 		 155 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  25.78 
 
 		 137 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2508  protein of unknown function DUF35  29.82 
 
 		 132 aa  43.1  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.347955  normal  0.395372 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  30.28 
 
 		 143 aa  43.1  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  33.57 
 
 		 141 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  31.96 
 
 		 130 aa  42.7  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2476  protein of unknown function DUF35  30.51 
 
 		 134 aa  42.7  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.73466  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  26.56 
 
 		 137 aa  42.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  26.61 
 
 		 130 aa  42.7  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>