34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2783 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2783  protein of unknown function DUF35  100 
 
 		 165 aa  340  5.999999999999999e-93  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.103009  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0269  hypothetical protein  72.73 
 
 		 165 aa  263  1e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000709024  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0268  hypothetical protein  46.51 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00125281  normal  0.120379 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2732  hypothetical protein  32.39 
 
 		 319 aa  74.7  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3983  protein of unknown function DUF35  34.44 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.411104  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5016  hypothetical protein  32.61 
 
 		 338 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4722  hypothetical protein  32.61 
 
 		 338 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4634  hypothetical protein  32.61 
 
 		 338 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3090  protein of unknown function DUF35  26.75 
 
 		 335 aa  70.9  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.697465 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2784  protein of unknown function DUF35  41.38 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0211194  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2839  hypothetical protein  30.5 
 
 		 319 aa  68.2  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11529  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13554  hypothetical protein  29.71 
 
 		 334 aa  67.8  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150735 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3818  protein of unknown function DUF35  28.99 
 
 		 320 aa  67.4  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.704476  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2642  hypothetical protein  28.37 
 
 		 329 aa  67  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13056  normal  0.212134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1482  nucleic-acid-binding protein containing a Zn- ribbon-like protein  31.43 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1538  hypothetical protein  27.34 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5220  hypothetical protein  23.6 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146278  normal  0.27671 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3784  protein of unknown function DUF35  27.95 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.0099748  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3964  protein of unknown function DUF35  30.34 
 
 		 329 aa  54.3  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0387  hypothetical protein  29.49 
 
 		 129 aa  51.2  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.448785  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  34.67 
 
 		 178 aa  51.2  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1310  hypothetical protein  31.65 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120998 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  38.46 
 
 		 177 aa  48.9  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  30.26 
 
 		 189 aa  48.5  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0436  protein of unknown function DUF35  29.87 
 
 		 128 aa  47  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.686015  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2762  hypothetical protein  26.97 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.10983  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  29.01 
 
 		 130 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  27.48 
 
 		 130 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  27.48 
 
 		 130 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  32 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1438  3-hydroxybutyryl-CoA epimerase  26.67 
 
 		 576 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.410853  normal  0.0151032 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1609  protein of unknown function DUF35  25.76 
 
 		 133 aa  40.8  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0155  hypothetical protein  28.97 
 
 		 130 aa  40.8  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0458  hypothetical protein  32.79 
 
 		 182 aa  40.4  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>