31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3964 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3964  protein of unknown function DUF35  100 
 
 		 329 aa  665    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13554  hypothetical protein  59.27 
 
 		 334 aa  385  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150735 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3818  protein of unknown function DUF35  58.7 
 
 		 320 aa  372  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.704476  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5016  hypothetical protein  56.76 
 
 		 338 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4634  hypothetical protein  55.86 
 
 		 338 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4722  hypothetical protein  55.86 
 
 		 338 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5220  hypothetical protein  57.41 
 
 		 330 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146278  normal  0.27671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1538  hypothetical protein  55.83 
 
 		 332 aa  359  3e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2732  hypothetical protein  53.77 
 
 		 319 aa  348  7e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2642  hypothetical protein  53.89 
 
 		 329 aa  328  6e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13056  normal  0.212134 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2839  hypothetical protein  53.04 
 
 		 319 aa  317  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11529  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3090  protein of unknown function DUF35  44.87 
 
 		 335 aa  262  6.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1482  nucleic-acid-binding protein containing a Zn- ribbon-like protein  47.02 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3983  protein of unknown function DUF35  42.9 
 
 		 309 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.411104  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  39.42 
 
 		 135 aa  58.9  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  30.16 
 
 		 130 aa  57.4  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2783  protein of unknown function DUF35  29.01 
 
 		 165 aa  54.7  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.103009  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0269  hypothetical protein  31.72 
 
 		 165 aa  51.2  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000709024  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  37.78 
 
 		 134 aa  48.9  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  29.13 
 
 		 142 aa  48.5  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  27.93 
 
 		 178 aa  46.2  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3784  protein of unknown function DUF35  27.74 
 
 		 165 aa  46.2  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.0099748  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  31.3 
 
 		 141 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  29.46 
 
 		 128 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  31.09 
 
 		 130 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  31.82 
 
 		 137 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1310  hypothetical protein  38.03 
 
 		 151 aa  43.9  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120998 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0155  hypothetical protein  32.58 
 
 		 130 aa  43.1  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  43.1  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  31.13 
 
 		 138 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  30.51 
 
 		 541 aa  42.7  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51495 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>