43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1482 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1482  nucleic-acid-binding protein containing a Zn- ribbon-like protein  100 
 
 		 295 aa  590  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3983  protein of unknown function DUF35  66.56 
 
 		 309 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.411104  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3090  protein of unknown function DUF35  58.44 
 
 		 335 aa  355  6.999999999999999e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2732  hypothetical protein  51.34 
 
 		 319 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3818  protein of unknown function DUF35  49.51 
 
 		 320 aa  271  1e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.704476  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2642  hypothetical protein  49.67 
 
 		 329 aa  259  4e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13056  normal  0.212134 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2839  hypothetical protein  49 
 
 		 319 aa  255  6e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11529  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5220  hypothetical protein  47.02 
 
 		 330 aa  251  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146278  normal  0.27671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1538  hypothetical protein  47.7 
 
 		 332 aa  251  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5016  hypothetical protein  47.74 
 
 		 338 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4634  hypothetical protein  46.77 
 
 		 338 aa  245  6e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4722  hypothetical protein  46.77 
 
 		 338 aa  245  6e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3964  protein of unknown function DUF35  46.36 
 
 		 329 aa  243  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13554  hypothetical protein  46 
 
 		 334 aa  243  3e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150735 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2783  protein of unknown function DUF35  31.43 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.103009  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  38.95 
 
 		 135 aa  62  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0269  hypothetical protein  27.63 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000709024  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2762  hypothetical protein  33.8 
 
 		 158 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.10983  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  34.78 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  25.47 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0268  hypothetical protein  32.67 
 
 		 141 aa  52.4  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00125281  normal  0.120379 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  32.32 
 
 		 132 aa  52  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  29.01 
 
 		 141 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  29.63 
 
 		 142 aa  50.4  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  49.3  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  27.36 
 
 		 177 aa  48.1  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  28.43 
 
 		 133 aa  46.6  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  28.57 
 
 		 319 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3784  protein of unknown function DUF35  24.46 
 
 		 165 aa  46.6  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.0099748  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2508  protein of unknown function DUF35  29.09 
 
 		 132 aa  46.2  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.347955  normal  0.395372 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  34.52 
 
 		 137 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  32.38 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  29.06 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  26.36 
 
 		 130 aa  44.3  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  32.26 
 
 		 136 aa  45.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2784  protein of unknown function DUF35  30.14 
 
 		 144 aa  44.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0211194  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  28.3 
 
 		 189 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  33.02 
 
 		 144 aa  43.5  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3906  hypothetical protein  34.95 
 
 		 143 aa  43.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0256992  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  33.96 
 
 		 136 aa  43.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  31.71 
 
 		 137 aa  43.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2476  protein of unknown function DUF35  36.11 
 
 		 134 aa  43.1  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.73466  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  33.02 
 
 		 132 aa  42.7  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>