51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1528 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1528  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  303  5.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.467127 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0940  hypothetical protein  31.25 
 
 		 153 aa  57  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  31.3 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  31.53 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3906  hypothetical protein  26.32 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0256992  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  30.63 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2863  hypothetical protein  29.84 
 
 		 172 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3365  hypothetical protein  29.84 
 
 		 172 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.810777  normal  0.110528 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  36.84 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  28.83 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4132  hypothetical protein  26.28 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479777  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4138  hypothetical protein  27.41 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.342554 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3624  hypothetical protein  33.58 
 
 		 149 aa  47.8  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3484  protein of unknown function DUF35  33.78 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  30.61 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3029  hypothetical protein  29.84 
 
 		 155 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.417482  normal  0.14022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2520  hypothetical protein  26.67 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167569  normal  0.666068 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  26.92 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3060  hypothetical protein  29.84 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.995907 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3014  hypothetical protein  29.84 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.764426  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1241  hypothetical protein  31.82 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0148077  normal  0.0127741 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  29.73 
 
 		 130 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0794  hypothetical protein  27.19 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3567  hypothetical protein  41.51 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  29.67 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  27.27 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11644  hypothetical protein  29.03 
 
 		 163 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.187499  normal  0.695339 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  29.33 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0984  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  43.5  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  29.76 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1357  hypothetical protein  30.09 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  27.4 
 
 		 140 aa  42.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  30.33 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  30.3 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1609  protein of unknown function DUF35  26.13 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  25.74 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1310  hypothetical protein  34.72 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120998 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0387  hypothetical protein  26.45 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.448785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  35.21 
 
 		 135 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  26.39 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3541  hypothetical protein  29.21 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0915855 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  29.79 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  31.65 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4154  hypothetical protein  34.43 
 
 		 397 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.880245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  32.43 
 
 		 319 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4526  hypothetical protein  39.62 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0992548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  28.21 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  30.34 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1972  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon-like protein  27.27 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0549  hypothetical protein  31.65 
 
 		 132 aa  40  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0854  protein of unknown function DUF35  27.27 
 
 		 116 aa  40  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0219431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>