79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0448 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0448  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  347  5e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423979  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5769  hypothetical protein  41.98 
 
 
147 aa  115  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3987  hypothetical protein  37.75 
 
 
152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0663  hypothetical protein  34.42 
 
 
146 aa  106  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595218  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1563  hypothetical protein  40.8 
 
 
150 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0156  hypothetical protein  38.26 
 
 
147 aa  106  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1540  hypothetical protein  40.8 
 
 
150 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.911889  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1511  hypothetical protein  40 
 
 
150 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.538962  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2726  hypothetical protein  35.29 
 
 
146 aa  99.8  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2939  hypothetical protein  38.41 
 
 
150 aa  99.8  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.255552  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2528  hypothetical protein  36.42 
 
 
149 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.691181  normal  0.557466 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4756  hypothetical protein  38.76 
 
 
147 aa  94.4  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4168  hypothetical protein  33.77 
 
 
146 aa  87.8  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504448  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4070  hypothetical protein  41.54 
 
 
147 aa  84.3  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5102  hypothetical protein  35.33 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2042  normal  0.841887 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1609  hypothetical protein  33.59 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3813  hypothetical protein  31.13 
 
 
148 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0202371  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4038  MaoC-like dehydratase  35.95 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4154  MaoC domain protein dehydratase  35.95 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.540186  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4181  MaoC domain protein dehydratase  35.95 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155418  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03550  acyl dehydratase  29.85 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413413  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5026  hypothetical protein  28.95 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000215714  normal  0.277815 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4077  hypothetical protein  31.79 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3723  hypothetical protein  31.79 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.575869  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4530  hypothetical protein  29.8 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.877257  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1009  hypothetical protein  34.87 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3941  hypothetical protein  30.32 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3027  hypothetical protein  31.71 
 
 
157 aa  67.4  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4363  MaoC domain protein dehydratase  28.48 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4333  hypothetical protein  29.8 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0564  hypothetical protein  40 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0288  hypothetical protein  36.46 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0741  MaoC-like dehydratase  29.29 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244833  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2693  MaoC domain protein dehydratase  33.06 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6066  hypothetical protein  32.37 
 
 
151 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.421262  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6647  hypothetical protein  29.8 
 
 
148 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0357  MaoC domain-containing protein dehydratase  32.76 
 
 
149 aa  62.4  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1778  hypothetical protein  25.52 
 
 
149 aa  60.5  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17520  hypothetical protein  32.86 
 
 
147 aa  60.5  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.414084  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21400  acyl dehydratase  30.41 
 
 
149 aa  60.5  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0000186279  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2739  hypothetical protein  32.06 
 
 
153 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705553 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2666  hypothetical protein  30.51 
 
 
152 aa  59.7  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.509352  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0898  hypothetical protein  28.93 
 
 
165 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.246332 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1060  hypothetical protein  31.16 
 
 
158 aa  59.7  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353069  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07680  hypothetical protein  28.93 
 
 
167 aa  59.3  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0469422 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  31.51 
 
 
335 aa  57.8  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3212  MaoC-like dehydratase  29.14 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.388942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3274  dehydratase  29.14 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3183  MaoC domain protein dehydratase  32.52 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0253382 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3223  dehydratase  29.14 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21190  acyl dehydratase  30.38 
 
 
180 aa  53.5  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4039  hypothetical protein  29.66 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.798553 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0390  MaoC-like dehydratase  30.67 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000306687 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0160  MaoC domain protein dehydratase  28.95 
 
 
151 aa  53.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.424795  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0664  hypothetical protein  32.82 
 
 
153 aa  52  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00923819  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2496  hypothetical protein  22.07 
 
 
149 aa  52  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0464  MaoC domain protein dehydratase  25.93 
 
 
339 aa  52  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.919633  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2840  MaoC domain protein dehydratase  31.5 
 
 
146 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0562  hypothetical protein  28.57 
 
 
160 aa  48.9  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0892456  normal  0.0661028 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13575  hypothetical protein  27.27 
 
 
311 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328171 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0599  MaoC-like dehydratase  28.8 
 
 
153 aa  47  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.598373  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  54.55 
 
 
312 aa  46.6  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1511  hypothetical protein  25 
 
 
317 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0671  dehydratase  32 
 
 
127 aa  44.7  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0318034  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  27.64 
 
 
337 aa  44.3  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0738  MaoC domain protein dehydratase  32.38 
 
 
188 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5255  hypothetical protein  24.55 
 
 
324 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6627  hypothetical protein  26.47 
 
 
158 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251415  normal  0.949835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0059  hypothetical protein  30.43 
 
 
173 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4674  hypothetical protein  31.03 
 
 
318 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4760  hypothetical protein  31.03 
 
 
318 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247642  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5059  hypothetical protein  31.03 
 
 
317 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.945383  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0885  protein of unknown function DUF35  45 
 
 
333 aa  42.4  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5844  dehydratase  32.26 
 
 
343 aa  42.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0665  MaoC domain protein dehydratase  25.88 
 
 
138 aa  42.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0187656  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0512  hypothetical protein  31.09 
 
 
326 aa  41.2  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5413  dehydratase  30.65 
 
 
343 aa  40.4  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5324  MaoC-like dehydratase  30.65 
 
 
343 aa  40.4  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5703  dehydratase  30.65 
 
 
343 aa  40.4  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>