96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0673 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_0686  dehydratase  100 
 
 
177 aa  357  6e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.169172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0666  dehydratase  100 
 
 
177 aa  357  6e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0673  MaoC-like dehydratase  100 
 
 
177 aa  357  6e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0842  MaoC-like dehydratase  76.4 
 
 
180 aa  288  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.659825  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0070  MaoC-like dehydratase  75.14 
 
 
182 aa  288  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112282  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10515  hypothetical protein  66.67 
 
 
166 aa  206  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10648  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  44.74 
 
 
158 aa  139  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.039671 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0935  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  42.76 
 
 
159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0918  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  42.76 
 
 
159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0669251  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5121  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  42.76 
 
 
159 aa  129  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10650  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  42.07 
 
 
166 aa  125  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0506433 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0946  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  41.45 
 
 
159 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1230  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  40.13 
 
 
159 aa  123  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.560314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0920  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  38.01 
 
 
169 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117088  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0937  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  38.01 
 
 
169 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0948  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  38.01 
 
 
169 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5119  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  38.19 
 
 
185 aa  105  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1009  hypothetical protein  38.46 
 
 
149 aa  104  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1232  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  38.19 
 
 
177 aa  103  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.581522 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5413  dehydratase  40.69 
 
 
343 aa  98.6  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5324  MaoC-like dehydratase  40.69 
 
 
343 aa  98.6  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2693  MaoC domain protein dehydratase  37.32 
 
 
150 aa  98.6  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5703  dehydratase  40.69 
 
 
343 aa  98.6  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2739  hypothetical protein  40.16 
 
 
153 aa  95.5  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705553 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5844  dehydratase  39.19 
 
 
343 aa  95.5  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0994  dehydratase  38.51 
 
 
343 aa  94  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3027  hypothetical protein  35.9 
 
 
157 aa  93.6  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4333  hypothetical protein  36.49 
 
 
148 aa  93.6  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0562  hypothetical protein  34.64 
 
 
160 aa  92.4  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0892456  normal  0.0661028 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1106  MaoC domain protein dehydratase  31.91 
 
 
352 aa  91.7  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212723  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4084  hypothetical protein  33.33 
 
 
185 aa  91.3  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2666  hypothetical protein  32.87 
 
 
152 aa  87.8  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.509352  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0288  hypothetical protein  35.46 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0464  MaoC domain protein dehydratase  37.96 
 
 
339 aa  87  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.919633  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17520  hypothetical protein  35.21 
 
 
147 aa  86.3  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.414084  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07680  hypothetical protein  35.83 
 
 
167 aa  83.6  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0469422 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3941  hypothetical protein  33.78 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5102  hypothetical protein  32.21 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2042  normal  0.841887 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0599  MaoC-like dehydratase  39.44 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.598373  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03550  acyl dehydratase  32.61 
 
 
147 aa  82  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413413  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0738  MaoC domain protein dehydratase  33.57 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4363  MaoC domain protein dehydratase  32.65 
 
 
145 aa  80.5  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6066  hypothetical protein  38.39 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.421262  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3183  MaoC domain protein dehydratase  34.96 
 
 
151 aa  77.4  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0253382 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21190  acyl dehydratase  31.91 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4530  hypothetical protein  31.47 
 
 
148 aa  76.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.877257  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6647  hypothetical protein  32.87 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0564  hypothetical protein  33.93 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0898  hypothetical protein  31.16 
 
 
165 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.246332 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0357  MaoC domain-containing protein dehydratase  27.27 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0741  MaoC-like dehydratase  29.45 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244833  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0663  hypothetical protein  28.57 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595218  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21400  acyl dehydratase  32.54 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0000186279  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1060  hypothetical protein  28.67 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353069  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4154  MaoC domain protein dehydratase  34.59 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.540186  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4181  MaoC domain protein dehydratase  34.59 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155418  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  30.29 
 
 
337 aa  62.4  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0664  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  61.6  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00923819  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4038  MaoC-like dehydratase  34.59 
 
 
144 aa  61.6  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0160  MaoC domain protein dehydratase  31.29 
 
 
151 aa  60.8  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.424795  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0156  hypothetical protein  33.67 
 
 
147 aa  60.8  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1609  hypothetical protein  28.93 
 
 
148 aa  57.4  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  31.08 
 
 
335 aa  54.7  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1778  hypothetical protein  29.23 
 
 
149 aa  54.7  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2840  MaoC domain protein dehydratase  32.14 
 
 
146 aa  54.3  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2528  hypothetical protein  30.89 
 
 
149 aa  53.9  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.691181  normal  0.557466 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0390  MaoC-like dehydratase  35.66 
 
 
145 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000306687 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3813  hypothetical protein  28.26 
 
 
148 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0202371  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2726  hypothetical protein  30.17 
 
 
146 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4168  hypothetical protein  31.71 
 
 
146 aa  51.6  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504448  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4273  hypothetical protein  26.35 
 
 
159 aa  51.2  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0955095 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1563  hypothetical protein  31.58 
 
 
150 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1540  hypothetical protein  31.58 
 
 
150 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.911889  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2678  hypothetical protein  25.48 
 
 
159 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0349464 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1511  hypothetical protein  30.53 
 
 
150 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.538962  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4756  hypothetical protein  31.85 
 
 
147 aa  47.8  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0035  hypothetical protein  28.33 
 
 
177 aa  48.1  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3987  hypothetical protein  28.7 
 
 
152 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0437  MaoC domain protein dehydratase  24.53 
 
 
163 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5026  hypothetical protein  31.25 
 
 
146 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000215714  normal  0.277815 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6220  MaoC domain protein dehydratase  26.96 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4077  hypothetical protein  27.78 
 
 
148 aa  45.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2496  hypothetical protein  26.15 
 
 
149 aa  45.1  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0162  dehydratase  24.43 
 
 
151 aa  45.1  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0670  hypothetical protein  24.83 
 
 
133 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0367273  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5769  hypothetical protein  27.45 
 
 
147 aa  43.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2340  dehydratase  35.56 
 
 
297 aa  42.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321088  decreased coverage  0.00219714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6627  hypothetical protein  23.85 
 
 
158 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251415  normal  0.949835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6365  hypothetical protein  29 
 
 
133 aa  42  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.937275  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3212  MaoC-like dehydratase  34.48 
 
 
152 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.388942  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2693  dehydratase  31.4 
 
 
151 aa  42  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215735  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3274  dehydratase  34.48 
 
 
152 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2939  hypothetical protein  27.27 
 
 
150 aa  42  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.255552  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3223  dehydratase  34.48 
 
 
152 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3000  MaoC domain-containing protein  31.4 
 
 
151 aa  42  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0628235  normal  0.0197508 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1858  Enoyl-CoA hydratase  27.97 
 
 
150 aa  41.2  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>