27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5358 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5358  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  375  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1852  hypothetical protein  46.11 
 
 		 178 aa  158  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0512  hypothetical protein  34.15 
 
 		 326 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3272  hypothetical protein  28 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3221  hypothetical protein  28 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.771398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3210  hypothetical protein  28 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.342499  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1696  hypothetical protein  32.06 
 
 		 348 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.896213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1645  hypothetical protein  32.06 
 
 		 348 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.817495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1672  hypothetical protein  32.06 
 
 		 348 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5645  hypothetical protein  32.06 
 
 		 348 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0531  hypothetical protein  32.06 
 
 		 348 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.426838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0552  hypothetical protein  32.06 
 
 		 348 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0634  hypothetical protein  32.06 
 
 		 348 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.366687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5849  hypothetical protein  31.3 
 
 		 348 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0326756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5452  hypothetical protein  31.3 
 
 		 348 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.080026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  26.15 
 
 		 319 aa  48.5  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0059  hypothetical protein  30.37 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  28.03 
 
 		 319 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3856  protein of unknown function DUF35  28.35 
 
 		 322 aa  45.8  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.343505  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  28.48 
 
 		 321 aa  42.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0160  MaoC domain protein dehydratase  27.48 
 
 		 151 aa  42.4  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.424795  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5059  hypothetical protein  25.49 
 
 		 317 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.945383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0885  protein of unknown function DUF35  28.68 
 
 		 333 aa  41.6  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4760  hypothetical protein  26.56 
 
 		 318 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4674  hypothetical protein  26.56 
 
 		 318 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13575  hypothetical protein  26.98 
 
 		 311 aa  41.2  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328171 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  29.41 
 
 		 312 aa  40.8  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>