25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3210 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3210  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  362  1e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.342499  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3272  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  362  1e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3221  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  362  1e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.771398  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0512  hypothetical protein  29.76 
 
 
326 aa  86.3  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  32.14 
 
 
319 aa  65.1  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5358  hypothetical protein  28 
 
 
179 aa  58.9  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720359  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1852  hypothetical protein  29.05 
 
 
178 aa  58.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134059  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0059  hypothetical protein  25.85 
 
 
173 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5645  hypothetical protein  29.93 
 
 
348 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0634  hypothetical protein  29.93 
 
 
348 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.366687  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0531  hypothetical protein  29.93 
 
 
348 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.426838  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0552  hypothetical protein  29.93 
 
 
348 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1645  hypothetical protein  29.93 
 
 
348 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.817495  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  25.3 
 
 
321 aa  53.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1696  hypothetical protein  29.93 
 
 
348 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.896213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1672  hypothetical protein  29.93 
 
 
348 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5849  hypothetical protein  29.93 
 
 
348 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0326756  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5452  hypothetical protein  29.93 
 
 
348 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.080026  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  25.77 
 
 
312 aa  48.1  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5059  hypothetical protein  23.33 
 
 
317 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.945383  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4760  hypothetical protein  24.53 
 
 
318 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247642  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4674  hypothetical protein  24.53 
 
 
318 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  27.64 
 
 
305 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1511  hypothetical protein  22.67 
 
 
317 aa  42.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5255  hypothetical protein  24.81 
 
 
324 aa  42  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.338508 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>