19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1852 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1852  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  364  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5358  hypothetical protein  46.11 
 
 		 179 aa  158  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3210  hypothetical protein  29.05 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.342499  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3221  hypothetical protein  29.05 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.771398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3272  hypothetical protein  29.05 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  29.38 
 
 		 319 aa  57  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1672  hypothetical protein  27.48 
 
 		 348 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1645  hypothetical protein  27.48 
 
 		 348 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.817495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1696  hypothetical protein  27.48 
 
 		 348 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.896213 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0512  hypothetical protein  26.32 
 
 		 326 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5849  hypothetical protein  27.48 
 
 		 348 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0326756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  31.88 
 
 		 321 aa  53.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5452  hypothetical protein  27.48 
 
 		 348 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.080026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0531  hypothetical protein  27.48 
 
 		 348 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.426838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0552  hypothetical protein  27.48 
 
 		 348 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0634  hypothetical protein  27.48 
 
 		 348 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.366687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5645  hypothetical protein  27.48 
 
 		 348 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  29.29 
 
 		 319 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  29.75 
 
 		 305 aa  45.1  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>