118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3274 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3212  MaoC-like dehydratase  100 
 
 
152 aa  308  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.388942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3274  dehydratase  100 
 
 
152 aa  308  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3223  dehydratase  100 
 
 
152 aa  308  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3813  hypothetical protein  42.22 
 
 
148 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0202371  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3987  hypothetical protein  40.4 
 
 
152 aa  102  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0156  hypothetical protein  39.55 
 
 
147 aa  100  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4038  MaoC-like dehydratase  38.62 
 
 
144 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4154  MaoC domain protein dehydratase  38.62 
 
 
144 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.540186  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4181  MaoC domain protein dehydratase  38.62 
 
 
144 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155418  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4077  hypothetical protein  41.79 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  36.17 
 
 
335 aa  89.4  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5769  hypothetical protein  37.68 
 
 
147 aa  88.2  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3723  hypothetical protein  39.07 
 
 
148 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.575869  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2528  hypothetical protein  35.53 
 
 
149 aa  85.5  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.691181  normal  0.557466 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  37.16 
 
 
337 aa  84.7  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5102  hypothetical protein  38.13 
 
 
149 aa  84  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2042  normal  0.841887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0741  MaoC-like dehydratase  34.9 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244833  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0390  MaoC-like dehydratase  40.69 
 
 
145 aa  81.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000306687 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4168  hypothetical protein  35.03 
 
 
146 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504448  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2726  hypothetical protein  32.21 
 
 
146 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03550  acyl dehydratase  39.83 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413413  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2939  hypothetical protein  32.21 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.255552  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0663  hypothetical protein  30.14 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595218  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1540  hypothetical protein  34.87 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.911889  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0288  hypothetical protein  38.35 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1563  hypothetical protein  34.87 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0898  hypothetical protein  37.06 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.246332 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4756  hypothetical protein  34.75 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4363  MaoC domain protein dehydratase  37.24 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1511  hypothetical protein  34.21 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.538962  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3183  MaoC domain protein dehydratase  37.14 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0253382 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21190  acyl dehydratase  34.81 
 
 
180 aa  73.6  0.0000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5026  hypothetical protein  34.39 
 
 
146 aa  73.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000215714  normal  0.277815 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0357  MaoC domain-containing protein dehydratase  35.66 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4333  hypothetical protein  38.03 
 
 
148 aa  72  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6066  hypothetical protein  34.31 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.421262  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4039  hypothetical protein  35.88 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.798553 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3941  hypothetical protein  36.62 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6627  hypothetical protein  30.2 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251415  normal  0.949835 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0448  hypothetical protein  29.14 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423979  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1009  hypothetical protein  39.13 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2666  hypothetical protein  31.34 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.509352  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0564  hypothetical protein  39 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07680  hypothetical protein  33.61 
 
 
167 aa  67.4  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0469422 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4530  hypothetical protein  33.58 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.877257  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17520  hypothetical protein  39.66 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.414084  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1060  hypothetical protein  33.33 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353069  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0160  MaoC domain protein dehydratase  30.15 
 
 
151 aa  63.5  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.424795  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6647  hypothetical protein  34.87 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4070  hypothetical protein  36.72 
 
 
147 aa  61.6  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1609  hypothetical protein  29.14 
 
 
148 aa  61.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4084  hypothetical protein  34.78 
 
 
185 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2693  MaoC domain protein dehydratase  33.61 
 
 
150 aa  58.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0070  MaoC-like dehydratase  34.21 
 
 
182 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112282  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3027  hypothetical protein  35.19 
 
 
157 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2496  hypothetical protein  26.62 
 
 
149 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4069  hypothetical protein  27.33 
 
 
166 aa  56.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.389962  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2739  hypothetical protein  35.19 
 
 
153 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705553 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21400  acyl dehydratase  32.33 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0000186279  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0512  hypothetical protein  27.4 
 
 
326 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0673  MaoC-like dehydratase  33.67 
 
 
177 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0686  dehydratase  33.67 
 
 
177 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.169172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0666  dehydratase  33.67 
 
 
177 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0994  dehydratase  31.21 
 
 
343 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0562  hypothetical protein  31.2 
 
 
160 aa  54.7  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0892456  normal  0.0661028 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0842  MaoC-like dehydratase  32.14 
 
 
180 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.659825  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1778  hypothetical protein  28.35 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5844  dehydratase  30.89 
 
 
343 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0599  MaoC-like dehydratase  31.9 
 
 
153 aa  50.8  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.598373  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5324  MaoC-like dehydratase  30.89 
 
 
343 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0738  MaoC domain protein dehydratase  38.46 
 
 
188 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5413  dehydratase  30.89 
 
 
343 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5703  dehydratase  30.89 
 
 
343 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0664  hypothetical protein  42.03 
 
 
153 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00923819  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0920  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  31.4 
 
 
169 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117088  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0937  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  31.4 
 
 
169 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2840  MaoC domain protein dehydratase  32.71 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0948  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  31.43 
 
 
169 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10515  hypothetical protein  29.2 
 
 
166 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3701  hypothetical protein  26.47 
 
 
405 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1641  MaoC-like dehydratase  30.51 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204847  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0464  MaoC domain protein dehydratase  29.27 
 
 
339 aa  45.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.919633  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13575  hypothetical protein  47.62 
 
 
311 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328171 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1106  MaoC domain protein dehydratase  29.46 
 
 
352 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212723  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5121  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  32.18 
 
 
159 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1289  MaoC-like dehydratase  30.43 
 
 
149 aa  43.9  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0013  dehydratase  35.04 
 
 
154 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1232  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  28.15 
 
 
177 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.581522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4559  hypothetical protein  27.07 
 
 
412 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6245  dehydratase  26.98 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0059  hypothetical protein  31.06 
 
 
173 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6530  dehydratase  26.98 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82464  normal  0.726262 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1511  hypothetical protein  45.24 
 
 
317 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5119  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  26.89 
 
 
185 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0918  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  29.89 
 
 
159 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0669251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0935  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  29.89 
 
 
159 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6403  dehydratase  28.57 
 
 
152 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.394709 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3229  hypothetical protein  27.4 
 
 
382 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.520523  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5645  hypothetical protein  24.48 
 
 
348 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0552  hypothetical protein  24.48 
 
 
348 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>