121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6647 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6647  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  298  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3941  hypothetical protein  59.18 
 
 		 156 aa  187  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4333  hypothetical protein  58.11 
 
 		 148 aa  185  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4530  hypothetical protein  58.9 
 
 		 148 aa  177  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.877257  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03550  acyl dehydratase  57.82 
 
 		 147 aa  178  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413413  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2693  MaoC domain protein dehydratase  55.1 
 
 		 150 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17520  hypothetical protein  53.96 
 
 		 147 aa  157  5e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.414084  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3027  hypothetical protein  52.9 
 
 		 157 aa  155  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0898  hypothetical protein  52.08 
 
 		 165 aa  154  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.246332 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4363  MaoC domain protein dehydratase  51.37 
 
 		 145 aa  151  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2739  hypothetical protein  52.32 
 
 		 153 aa  150  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705553 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2666  hypothetical protein  49.32 
 
 		 152 aa  148  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.509352  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07680  hypothetical protein  46.88 
 
 		 167 aa  146  8e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0469422 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3183  MaoC domain protein dehydratase  52.78 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0253382 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1009  hypothetical protein  50 
 
 		 149 aa  144  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5102  hypothetical protein  48.63 
 
 		 149 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2042  normal  0.841887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0741  MaoC-like dehydratase  47.26 
 
 		 148 aa  140  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21400  acyl dehydratase  46.53 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0000186279  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0599  MaoC-like dehydratase  52.74 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.598373  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0288  hypothetical protein  51.06 
 
 		 145 aa  138  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0357  MaoC domain-containing protein dehydratase  48.28 
 
 		 149 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0562  hypothetical protein  43.67 
 
 		 160 aa  131  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0892456  normal  0.0661028 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6066  hypothetical protein  47.26 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.421262  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0564  hypothetical protein  43.84 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0664  hypothetical protein  47.59 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00923819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1060  hypothetical protein  43.36 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353069  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21190  acyl dehydratase  41.91 
 
 		 180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6365  hypothetical protein  41.67 
 
 		 133 aa  98.2  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.937275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0670  hypothetical protein  37.67 
 
 		 133 aa  98.2  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0367273  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0070  MaoC-like dehydratase  38.19 
 
 		 182 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2840  MaoC domain protein dehydratase  38.36 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0920  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  36.09 
 
 		 169 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117088  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0937  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  36.09 
 
 		 169 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0948  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  36.09 
 
 		 169 aa  90.5  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0156  hypothetical protein  33.79 
 
 		 147 aa  90.1  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0738  MaoC domain protein dehydratase  36.17 
 
 		 188 aa  88.6  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4038  MaoC-like dehydratase  37.41 
 
 		 144 aa  87.4  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0994  dehydratase  36.62 
 
 		 343 aa  87  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5844  dehydratase  35.92 
 
 		 343 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2678  hypothetical protein  30.82 
 
 		 159 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0349464 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10515  hypothetical protein  34.78 
 
 		 166 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0464  MaoC domain protein dehydratase  36.69 
 
 		 339 aa  85.9  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.919633  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1232  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  33.57 
 
 		 177 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581522 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4154  MaoC domain protein dehydratase  36.73 
 
 		 144 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.540186  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4181  MaoC domain protein dehydratase  36.73 
 
 		 144 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155418  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1540  hypothetical protein  34.97 
 
 		 150 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.911889  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1563  hypothetical protein  34.97 
 
 		 150 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5119  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  32.17 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2726  hypothetical protein  34.93 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0673  MaoC-like dehydratase  32.87 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0686  dehydratase  32.87 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.169172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3987  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4084  hypothetical protein  32.35 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0666  dehydratase  32.87 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1511  hypothetical protein  34.27 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.538962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0842  MaoC-like dehydratase  33.11 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.659825  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5324  MaoC-like dehydratase  35.92 
 
 		 343 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5413  dehydratase  35.92 
 
 		 343 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5703  dehydratase  35.92 
 
 		 343 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1609  hypothetical protein  30.82 
 
 		 148 aa  80.1  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1106  MaoC domain protein dehydratase  32.87 
 
 		 352 aa  80.1  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212723  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3813  hypothetical protein  34.69 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0202371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4168  hypothetical protein  36.29 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504448  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5121  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  31.97 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3723  hypothetical protein  36.73 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.575869  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0918  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  31.97 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0669251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0935  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  31.97 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0946  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  31.97 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0390  MaoC-like dehydratase  37.41 
 
 		 145 aa  76.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000306687 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5769  hypothetical protein  31.72 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10648  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  29.66 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.039671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4756  hypothetical protein  34.88 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4070  hypothetical protein  35.86 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4077  hypothetical protein  35.37 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0448  hypothetical protein  29.8 
 
 		 170 aa  73.6  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5026  hypothetical protein  36.15 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000215714  normal  0.277815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6627  hypothetical protein  29.17 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251415  normal  0.949835 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0663  hypothetical protein  29.25 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595218  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2528  hypothetical protein  33.56 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.691181  normal  0.557466 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10650  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  28.67 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0506433 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1230  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  29.93 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560314 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2687  hypothetical protein  34.18 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0160  MaoC domain protein dehydratase  31.34 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.424795  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  31.08 
 
 		 335 aa  65.1  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2780  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.189937  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2939  hypothetical protein  29.93 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.255552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3212  MaoC-like dehydratase  34.87 
 
 		 152 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.388942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3274  dehydratase  34.87 
 
 		 152 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3223  dehydratase  34.87 
 
 		 152 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2873  hypothetical protein  32.7 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  28.57 
 
 		 337 aa  57  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  30.66 
 
 		 319 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1778  hypothetical protein  27.13 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4069  hypothetical protein  29.03 
 
 		 166 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.389962  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2340  dehydratase  32.58 
 
 		 297 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321088  decreased coverage  0.00219714 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4039  hypothetical protein  32.59 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.798553 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3000  MaoC domain-containing protein  28.15 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0628235  normal  0.0197508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2693  dehydratase  28.15 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2496  hypothetical protein  24.81 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0059  hypothetical protein  31.88 
 
 		 173 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>