84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0920 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_0937  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  100 
 
 
169 aa  348  3e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0920  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  100 
 
 
169 aa  348  3e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117088  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0948  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  98.22 
 
 
169 aa  340  4e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1232  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  82.74 
 
 
177 aa  288  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.581522 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5119  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  81.44 
 
 
185 aa  281  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10650  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  62.65 
 
 
166 aa  233  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0506433 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5121  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  50 
 
 
159 aa  143  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0935  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  47.92 
 
 
159 aa  141  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0918  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  47.92 
 
 
159 aa  141  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0669251  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10648  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  44 
 
 
158 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.039671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0946  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  45.75 
 
 
159 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1230  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  42.76 
 
 
159 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.560314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0070  MaoC-like dehydratase  41.26 
 
 
182 aa  120  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112282  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0842  MaoC-like dehydratase  40.28 
 
 
180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.659825  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0673  MaoC-like dehydratase  38.01 
 
 
177 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0666  dehydratase  38.01 
 
 
177 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0686  dehydratase  38.01 
 
 
177 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.169172 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4084  hypothetical protein  35.46 
 
 
185 aa  106  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3027  hypothetical protein  37.59 
 
 
157 aa  103  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0738  MaoC domain protein dehydratase  33.78 
 
 
188 aa  101  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2739  hypothetical protein  38.4 
 
 
153 aa  100  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705553 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10515  hypothetical protein  37.5 
 
 
166 aa  100  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2693  MaoC domain protein dehydratase  34 
 
 
150 aa  99.4  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5413  dehydratase  38.24 
 
 
343 aa  94.4  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5324  MaoC-like dehydratase  38.24 
 
 
343 aa  94.4  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5703  dehydratase  38.24 
 
 
343 aa  94.4  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0464  MaoC domain protein dehydratase  40.43 
 
 
339 aa  94  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.919633  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17520  hypothetical protein  34.75 
 
 
147 aa  93.2  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.414084  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1106  MaoC domain protein dehydratase  31.29 
 
 
352 aa  92  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212723  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4333  hypothetical protein  32.87 
 
 
148 aa  91.3  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5844  dehydratase  37.5 
 
 
343 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3941  hypothetical protein  33.57 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0898  hypothetical protein  32.87 
 
 
165 aa  87.4  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.246332 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1009  hypothetical protein  31.47 
 
 
149 aa  85.9  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6647  hypothetical protein  36.09 
 
 
148 aa  85.1  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07680  hypothetical protein  34.15 
 
 
167 aa  84.7  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0469422 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0994  dehydratase  35.46 
 
 
343 aa  84.3  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4530  hypothetical protein  33.57 
 
 
148 aa  82.4  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.877257  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0599  MaoC-like dehydratase  31.43 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.598373  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0288  hypothetical protein  35.25 
 
 
145 aa  80.1  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5102  hypothetical protein  29.05 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2042  normal  0.841887 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1060  hypothetical protein  31.65 
 
 
158 aa  77  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353069  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0562  hypothetical protein  31.45 
 
 
160 aa  75.5  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0892456  normal  0.0661028 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0357  MaoC domain-containing protein dehydratase  30.61 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6066  hypothetical protein  31.47 
 
 
151 aa  73.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.421262  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2666  hypothetical protein  28.67 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.509352  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03550  acyl dehydratase  30.07 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413413  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0663  hypothetical protein  31.78 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595218  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21400  acyl dehydratase  29.13 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0000186279  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4038  MaoC-like dehydratase  35.66 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4154  MaoC domain protein dehydratase  32.87 
 
 
144 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.540186  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4181  MaoC domain protein dehydratase  32.87 
 
 
144 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155418  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3183  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0253382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0741  MaoC-like dehydratase  26.53 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244833  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0564  hypothetical protein  31.51 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0664  hypothetical protein  35.35 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00923819  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21190  acyl dehydratase  31.01 
 
 
180 aa  62  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4363  MaoC domain protein dehydratase  26.57 
 
 
145 aa  62  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1540  hypothetical protein  31.97 
 
 
150 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.911889  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1563  hypothetical protein  31.97 
 
 
150 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1511  hypothetical protein  31.29 
 
 
150 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.538962  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0670  hypothetical protein  27.33 
 
 
133 aa  58.5  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0367273  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0390  MaoC-like dehydratase  35.34 
 
 
145 aa  57.8  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000306687 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2678  hypothetical protein  25.64 
 
 
159 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0349464 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2840  MaoC domain protein dehydratase  33.62 
 
 
146 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5769  hypothetical protein  29.17 
 
 
147 aa  54.3  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2726  hypothetical protein  28.57 
 
 
146 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1609  hypothetical protein  27.91 
 
 
148 aa  53.9  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3987  hypothetical protein  29.27 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0160  MaoC domain protein dehydratase  30 
 
 
151 aa  53.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.424795  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4168  hypothetical protein  30.71 
 
 
146 aa  51.2  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504448  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2528  hypothetical protein  30.88 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.691181  normal  0.557466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6627  hypothetical protein  27.33 
 
 
158 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251415  normal  0.949835 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0156  hypothetical protein  31 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6365  hypothetical protein  32.67 
 
 
133 aa  48.9  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.937275  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5026  hypothetical protein  30.16 
 
 
146 aa  49.3  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000215714  normal  0.277815 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  26.17 
 
 
335 aa  48.5  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2939  hypothetical protein  28.97 
 
 
150 aa  48.5  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.255552  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1778  hypothetical protein  23.66 
 
 
149 aa  45.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3813  hypothetical protein  23.85 
 
 
148 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0202371  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4070  hypothetical protein  28.15 
 
 
147 aa  45.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  24 
 
 
337 aa  43.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  25.19 
 
 
319 aa  42  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4077  hypothetical protein  20.61 
 
 
148 aa  41.6  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.372535 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>