85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0670 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0670  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  267  5e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0367273  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6647  hypothetical protein  37.67 
 
 		 148 aa  98.6  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4530  hypothetical protein  38.36 
 
 		 148 aa  90.9  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.877257  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4333  hypothetical protein  38.36 
 
 		 148 aa  88.6  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1009  hypothetical protein  36.84 
 
 		 149 aa  87.8  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3941  hypothetical protein  36.49 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2693  MaoC domain protein dehydratase  37.24 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4363  MaoC domain protein dehydratase  33.56 
 
 		 145 aa  84.7  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0741  MaoC-like dehydratase  33.11 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0288  hypothetical protein  39.13 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2666  hypothetical protein  33.56 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.509352  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03550  acyl dehydratase  34.25 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0898  hypothetical protein  32.87 
 
 		 165 aa  77  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.246332 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6066  hypothetical protein  32.89 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.421262  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17520  hypothetical protein  30.56 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.414084  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3183  MaoC domain protein dehydratase  35.37 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0253382 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3027  hypothetical protein  30.77 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07680  hypothetical protein  29.81 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0469422 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2739  hypothetical protein  30.92 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705553 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1060  hypothetical protein  29.37 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353069  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0357  MaoC domain-containing protein dehydratase  30.87 
 
 		 149 aa  67  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5102  hypothetical protein  28.29 
 
 		 149 aa  67  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2042  normal  0.841887 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6365  hypothetical protein  31.75 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.937275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21400  acyl dehydratase  32.87 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0000186279  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0562  hypothetical protein  28.12 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0892456  normal  0.0661028 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2678  hypothetical protein  31.25 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0349464 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0599  MaoC-like dehydratase  33.33 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.598373  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21190  acyl dehydratase  31.43 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4077  hypothetical protein  35.37 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10648  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  30.87 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.039671 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3723  hypothetical protein  33.78 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.575869  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0564  hypothetical protein  28.77 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0937  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  27.33 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0920  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  27.33 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117088  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0948  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  27.89 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1230  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  30.34 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560314 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0464  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 		 339 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.919633  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0664  hypothetical protein  34.72 
 
 		 153 aa  57  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00923819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3813  hypothetical protein  34.01 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0202371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0935  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  30.3 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0918  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  30.3 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0669251  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2726  hypothetical protein  29.66 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1232  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  27.33 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581522 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10650  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  31.85 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0506433 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0946  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  31.06 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3987  hypothetical protein  27.33 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4070  hypothetical protein  30.41 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2780  hypothetical protein  27.85 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.189937  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0390  MaoC-like dehydratase  29.05 
 
 		 145 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000306687 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5119  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  25.33 
 
 		 185 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2873  hypothetical protein  27.22 
 
 		 162 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5121  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  26.9 
 
 		 159 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5413  dehydratase  30.95 
 
 		 343 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0156  hypothetical protein  25.34 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5324  MaoC-like dehydratase  30.95 
 
 		 343 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5703  dehydratase  30.95 
 
 		 343 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4827  MaoC domain protein dehydratase  32.28 
 
 		 279 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2687  hypothetical protein  25.61 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  29.71 
 
 		 337 aa  48.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4038  MaoC-like dehydratase  28.38 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4168  hypothetical protein  28.28 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504448  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0160  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.424795  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2340  dehydratase  31.15 
 
 		 297 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321088  decreased coverage  0.00219714 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5026  hypothetical protein  27.89 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000215714  normal  0.277815 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4756  hypothetical protein  28.44 
 
 		 147 aa  47.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0663  hypothetical protein  26.53 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595218  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4181  MaoC domain protein dehydratase  27.7 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155418  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4154  MaoC domain protein dehydratase  27.7 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.540186  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  33.98 
 
 		 335 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2528  hypothetical protein  28.77 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.691181  normal  0.557466 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0738  MaoC domain protein dehydratase  30.07 
 
 		 188 aa  44.3  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0673  MaoC-like dehydratase  24.83 
 
 		 177 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0686  dehydratase  24.83 
 
 		 177 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.169172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0666  dehydratase  24.83 
 
 		 177 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0994  dehydratase  29.89 
 
 		 343 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5769  hypothetical protein  25.17 
 
 		 147 aa  41.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6627  hypothetical protein  29.03 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251415  normal  0.949835 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5844  dehydratase  25.55 
 
 		 343 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2840  MaoC domain protein dehydratase  24.67 
 
 		 146 aa  41.2  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1511  hypothetical protein  33.67 
 
 		 150 aa  40.8  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.538962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1540  hypothetical protein  33.67 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.911889  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1563  hypothetical protein  33.67 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10515  hypothetical protein  24.65 
 
 		 166 aa  40.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0842  MaoC-like dehydratase  24.14 
 
 		 180 aa  40.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.659825  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2939  hypothetical protein  25.52 
 
 		 150 aa  40  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.255552  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>