79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0738 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0738  MaoC domain protein dehydratase  100 
 
 		 188 aa  385  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4084  hypothetical protein  47.37 
 
 		 185 aa  161  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1106  MaoC domain protein dehydratase  39.88 
 
 		 352 aa  134  6.0000000000000005e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212723  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5844  dehydratase  39.31 
 
 		 343 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5324  MaoC-like dehydratase  39.62 
 
 		 343 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5413  dehydratase  39.62 
 
 		 343 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5703  dehydratase  39.62 
 
 		 343 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0918  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  40.14 
 
 		 159 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0669251  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1230  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  39.6 
 
 		 159 aa  108  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560314 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0935  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  40.14 
 
 		 159 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10648  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  38.1 
 
 		 158 aa  108  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.039671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5121  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  38.41 
 
 		 159 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0994  dehydratase  38.99 
 
 		 343 aa  106  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0464  MaoC domain protein dehydratase  38.65 
 
 		 339 aa  106  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.919633  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0946  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  37.75 
 
 		 159 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0920  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  33.78 
 
 		 169 aa  101  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117088  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0937  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  33.78 
 
 		 169 aa  101  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0948  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  33.78 
 
 		 169 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1232  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  31.85 
 
 		 177 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581522 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2693  MaoC domain protein dehydratase  42.86 
 
 		 150 aa  94  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10650  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  34.75 
 
 		 166 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0506433 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5119  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  33.56 
 
 		 185 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3941  hypothetical protein  38.03 
 
 		 156 aa  87.8  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0070  MaoC-like dehydratase  32.87 
 
 		 182 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2739  hypothetical protein  37.93 
 
 		 153 aa  85.5  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705553 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4530  hypothetical protein  35.86 
 
 		 148 aa  85.1  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.877257  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3027  hypothetical protein  41.18 
 
 		 157 aa  84  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4333  hypothetical protein  35.51 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0686  dehydratase  33.57 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.169172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0666  dehydratase  33.57 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0673  MaoC-like dehydratase  33.57 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17520  hypothetical protein  37.14 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.414084  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5102  hypothetical protein  32.62 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2042  normal  0.841887 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07680  hypothetical protein  33.97 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0469422 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0842  MaoC-like dehydratase  31.65 
 
 		 180 aa  77.8  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.659825  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1009  hypothetical protein  36.43 
 
 		 149 aa  77.4  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6647  hypothetical protein  36.17 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0599  MaoC-like dehydratase  35.92 
 
 		 153 aa  73.9  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.598373  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3183  MaoC domain protein dehydratase  35.42 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0253382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0741  MaoC-like dehydratase  34.81 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10515  hypothetical protein  32.12 
 
 		 166 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21190  acyl dehydratase  31.79 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0288  hypothetical protein  35 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03550  acyl dehydratase  33.57 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6066  hypothetical protein  32.17 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.421262  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0357  MaoC domain-containing protein dehydratase  30.71 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21400  acyl dehydratase  33.06 
 
 		 149 aa  67  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0000186279  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0562  hypothetical protein  31.85 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0892456  normal  0.0661028 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4363  MaoC domain protein dehydratase  31.91 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2666  hypothetical protein  31.69 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.509352  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0898  hypothetical protein  29.79 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.246332 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0663  hypothetical protein  31.01 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595218  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0564  hypothetical protein  30.94 
 
 		 153 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1540  hypothetical protein  31.5 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.911889  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1563  hypothetical protein  31.5 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0156  hypothetical protein  29.23 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  29.94 
 
 		 335 aa  55.1  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1511  hypothetical protein  31.62 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.538962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3987  hypothetical protein  34.75 
 
 		 152 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4181  MaoC domain protein dehydratase  30 
 
 		 144 aa  51.6  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155418  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4154  MaoC domain protein dehydratase  30 
 
 		 144 aa  51.6  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.540186  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4038  MaoC-like dehydratase  30 
 
 		 144 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1060  hypothetical protein  26.8 
 
 		 158 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353069  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6627  hypothetical protein  28.47 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251415  normal  0.949835 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0664  hypothetical protein  32.74 
 
 		 153 aa  50.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00923819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5769  hypothetical protein  27.12 
 
 		 147 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1609  hypothetical protein  27.27 
 
 		 148 aa  49.3  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2840  MaoC domain protein dehydratase  34.92 
 
 		 146 aa  48.9  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3813  hypothetical protein  28.68 
 
 		 148 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0202371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2496  hypothetical protein  28.36 
 
 		 149 aa  48.1  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2939  hypothetical protein  31.01 
 
 		 150 aa  47.8  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.255552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0670  hypothetical protein  30.07 
 
 		 133 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0367273  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2678  hypothetical protein  25.53 
 
 		 159 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0349464 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0448  hypothetical protein  32.38 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1778  hypothetical protein  24.63 
 
 		 149 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4077  hypothetical protein  27.91 
 
 		 148 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4756  hypothetical protein  25.98 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2726  hypothetical protein  26.77 
 
 		 146 aa  42  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0390  MaoC-like dehydratase  34.07 
 
 		 145 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000306687 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>