75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0918 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_0935  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  100 
 
 
159 aa  327  3e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0918  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  100 
 
 
159 aa  327  3e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0669251  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0946  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  88.68 
 
 
159 aa  297  4e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5121  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  81.13 
 
 
159 aa  274  3e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1230  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  78.62 
 
 
159 aa  270  6e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.560314 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10648  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  67.3 
 
 
158 aa  224  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.039671 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10650  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  45.62 
 
 
166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0506433 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0937  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  47.92 
 
 
169 aa  141  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0920  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  47.92 
 
 
169 aa  141  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117088  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0948  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  47.92 
 
 
169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0666  dehydratase  42.76 
 
 
177 aa  130  9e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0686  dehydratase  42.76 
 
 
177 aa  130  9e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.169172 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0673  MaoC-like dehydratase  42.76 
 
 
177 aa  130  9e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0842  MaoC-like dehydratase  40.13 
 
 
180 aa  128  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.659825  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10515  hypothetical protein  44.53 
 
 
166 aa  127  6e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1232  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  40.76 
 
 
177 aa  120  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.581522 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5119  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  42.04 
 
 
185 aa  117  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0070  MaoC-like dehydratase  38.41 
 
 
182 aa  117  7.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112282  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4084  hypothetical protein  40.14 
 
 
185 aa  111  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5324  MaoC-like dehydratase  41.89 
 
 
343 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5703  dehydratase  41.89 
 
 
343 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5413  dehydratase  41.89 
 
 
343 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5844  dehydratase  40.79 
 
 
343 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0738  MaoC domain protein dehydratase  40.14 
 
 
188 aa  108  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0994  dehydratase  38.82 
 
 
343 aa  102  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0464  MaoC domain protein dehydratase  39.04 
 
 
339 aa  102  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.919633  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1106  MaoC domain protein dehydratase  36.11 
 
 
352 aa  97.8  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212723  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2693  MaoC domain protein dehydratase  34 
 
 
150 aa  87.4  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1009  hypothetical protein  31.08 
 
 
149 aa  87.4  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2739  hypothetical protein  37.32 
 
 
153 aa  84.3  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705553 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4333  hypothetical protein  31.97 
 
 
148 aa  84.3  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3941  hypothetical protein  31.97 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3027  hypothetical protein  38.58 
 
 
157 aa  80.9  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0599  MaoC-like dehydratase  35.66 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.598373  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5102  hypothetical protein  30.41 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2042  normal  0.841887 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0288  hypothetical protein  37.5 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2666  hypothetical protein  30.07 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.509352  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6647  hypothetical protein  31.97 
 
 
148 aa  73.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17520  hypothetical protein  31.47 
 
 
147 aa  73.6  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.414084  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0562  hypothetical protein  33.87 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0892456  normal  0.0661028 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07680  hypothetical protein  32.48 
 
 
167 aa  73.2  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0469422 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1060  hypothetical protein  30.07 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353069  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0898  hypothetical protein  28.87 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.246332 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4530  hypothetical protein  31.72 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.877257  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4363  MaoC domain protein dehydratase  28.28 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3183  MaoC domain protein dehydratase  30.34 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0253382 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0357  MaoC domain-containing protein dehydratase  27.59 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6066  hypothetical protein  28.08 
 
 
151 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.421262  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03550  acyl dehydratase  29.93 
 
 
147 aa  61.6  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413413  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0741  MaoC-like dehydratase  26.9 
 
 
148 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244833  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0564  hypothetical protein  28.57 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0663  hypothetical protein  28.46 
 
 
146 aa  57.4  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595218  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0670  hypothetical protein  30.3 
 
 
133 aa  56.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0367273  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21400  acyl dehydratase  27.34 
 
 
149 aa  54.7  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0000186279  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0160  MaoC domain protein dehydratase  24.48 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.424795  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0664  hypothetical protein  28.7 
 
 
153 aa  48.5  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00923819  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2726  hypothetical protein  25.6 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4181  MaoC domain protein dehydratase  25 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155418  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4154  MaoC domain protein dehydratase  25 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.540186  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6365  hypothetical protein  30 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.937275  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21190  acyl dehydratase  24.11 
 
 
180 aa  45.4  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4168  hypothetical protein  26.19 
 
 
146 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504448  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1563  hypothetical protein  28.57 
 
 
150 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1540  hypothetical protein  28.57 
 
 
150 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.911889  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4038  MaoC-like dehydratase  23.61 
 
 
144 aa  44.3  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6627  hypothetical protein  26.02 
 
 
158 aa  44.3  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251415  normal  0.949835 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1511  hypothetical protein  27.82 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.538962  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2939  hypothetical protein  26.85 
 
 
150 aa  43.9  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.255552  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  21.88 
 
 
337 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2496  hypothetical protein  24.14 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2528  hypothetical protein  23.85 
 
 
149 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.691181  normal  0.557466 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2840  MaoC domain protein dehydratase  28.95 
 
 
146 aa  42  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0156  hypothetical protein  26.13 
 
 
147 aa  41.2  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1778  hypothetical protein  22.99 
 
 
149 aa  40.8  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5026  hypothetical protein  24 
 
 
146 aa  40.4  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000215714  normal  0.277815 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>