88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1609 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1609  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  299  8.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2726  hypothetical protein  50 
 
 
146 aa  142  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5769  hypothetical protein  51.01 
 
 
147 aa  140  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0156  hypothetical protein  48.99 
 
 
147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4168  hypothetical protein  49.32 
 
 
146 aa  137  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504448  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4070  hypothetical protein  50 
 
 
147 aa  135  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2528  hypothetical protein  49.66 
 
 
149 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.691181  normal  0.557466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5026  hypothetical protein  48.63 
 
 
146 aa  134  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000215714  normal  0.277815 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4756  hypothetical protein  46.31 
 
 
147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0663  hypothetical protein  45.21 
 
 
146 aa  124  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595218  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2939  hypothetical protein  44.14 
 
 
150 aa  117  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.255552  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3813  hypothetical protein  43.62 
 
 
148 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0202371  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3987  hypothetical protein  40.13 
 
 
152 aa  113  8.999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4077  hypothetical protein  41.22 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1540  hypothetical protein  41.43 
 
 
150 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.911889  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1563  hypothetical protein  41.43 
 
 
150 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1511  hypothetical protein  41.43 
 
 
150 aa  107  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.538962  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3723  hypothetical protein  39.6 
 
 
148 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.575869  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03550  acyl dehydratase  36.3 
 
 
147 aa  97.4  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413413  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5102  hypothetical protein  33.56 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2042  normal  0.841887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0741  MaoC-like dehydratase  33.11 
 
 
148 aa  82  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244833  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21400  acyl dehydratase  35.56 
 
 
149 aa  80.5  0.000000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0000186279  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4333  hypothetical protein  35.37 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3941  hypothetical protein  36.05 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0448  hypothetical protein  33.59 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423979  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4363  MaoC domain protein dehydratase  32.88 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4038  MaoC-like dehydratase  34.25 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4154  MaoC domain protein dehydratase  33.56 
 
 
144 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.540186  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4181  MaoC domain protein dehydratase  33.56 
 
 
144 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155418  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6066  hypothetical protein  35.61 
 
 
151 aa  73.6  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.421262  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0898  hypothetical protein  34.88 
 
 
165 aa  73.6  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.246332 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3183  MaoC domain protein dehydratase  31.76 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0253382 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4530  hypothetical protein  32.19 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.877257  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2666  hypothetical protein  29.93 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.509352  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0357  MaoC domain-containing protein dehydratase  33.78 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2693  MaoC domain protein dehydratase  31.25 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1009  hypothetical protein  34 
 
 
149 aa  70.5  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6647  hypothetical protein  30.82 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0390  MaoC-like dehydratase  33.78 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000306687 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2739  hypothetical protein  34.31 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705553 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17520  hypothetical protein  29.93 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.414084  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0562  hypothetical protein  29.94 
 
 
160 aa  67.4  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0892456  normal  0.0661028 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3027  hypothetical protein  33.33 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0160  MaoC domain protein dehydratase  30.88 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.424795  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0564  hypothetical protein  31.67 
 
 
153 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  29.03 
 
 
335 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07680  hypothetical protein  28.81 
 
 
167 aa  60.8  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0469422 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1060  hypothetical protein  29.22 
 
 
158 aa  60.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353069  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0070  MaoC-like dehydratase  26.89 
 
 
182 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112282  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0842  MaoC-like dehydratase  30.51 
 
 
180 aa  57.8  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.659825  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21190  acyl dehydratase  30.83 
 
 
180 aa  57.8  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4039  hypothetical protein  30.15 
 
 
144 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.798553 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0673  MaoC-like dehydratase  28.93 
 
 
177 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0686  dehydratase  28.93 
 
 
177 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.169172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0666  dehydratase  28.93 
 
 
177 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0288  hypothetical protein  36.9 
 
 
145 aa  57  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  26.28 
 
 
337 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1778  hypothetical protein  29.06 
 
 
149 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0664  hypothetical protein  31.3 
 
 
153 aa  55.1  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00923819  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0599  MaoC-like dehydratase  32.8 
 
 
153 aa  55.1  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.598373  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2678  hypothetical protein  29.05 
 
 
159 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0349464 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0937  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  27.91 
 
 
169 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0920  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  27.91 
 
 
169 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117088  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2496  hypothetical protein  28.91 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0948  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  27.91 
 
 
169 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  25.19 
 
 
319 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6627  hypothetical protein  26.45 
 
 
158 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251415  normal  0.949835 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0738  MaoC domain protein dehydratase  27.27 
 
 
188 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10515  hypothetical protein  27.43 
 
 
166 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0994  dehydratase  26.4 
 
 
343 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10650  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  28.03 
 
 
166 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0506433 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3223  dehydratase  29.14 
 
 
152 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3212  MaoC-like dehydratase  29.14 
 
 
152 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.388942  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2840  MaoC domain protein dehydratase  28.91 
 
 
146 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3274  dehydratase  29.14 
 
 
152 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6365  hypothetical protein  32.63 
 
 
133 aa  47  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.937275  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13575  hypothetical protein  29.03 
 
 
311 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328171 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10648  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  24.24 
 
 
158 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.039671 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1106  MaoC domain protein dehydratase  27.47 
 
 
352 aa  43.9  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212723  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1232  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  26.96 
 
 
177 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.581522 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0490  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  27 
 
 
283 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0885  protein of unknown function DUF35  25.32 
 
 
333 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4559  hypothetical protein  25.66 
 
 
412 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5119  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  26.96 
 
 
185 aa  40.8  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1511  hypothetical protein  30.08 
 
 
317 aa  40.8  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3807  putative dehydratase  30.77 
 
 
297 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0195  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  30.77 
 
 
315 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0121  dehydratase  32.86 
 
 
297 aa  40  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.254652 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>