87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1232 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1232  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  100 
 
 
177 aa  363  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.581522 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5119  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  91.18 
 
 
185 aa  330  6e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0937  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  82.74 
 
 
169 aa  288  3e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0920  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  82.74 
 
 
169 aa  288  3e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117088  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0948  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  82.74 
 
 
169 aa  286  8e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10650  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  59.76 
 
 
166 aa  216  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0506433 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10648  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  42.28 
 
 
158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.039671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0946  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  43.31 
 
 
159 aa  128  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5121  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  42.68 
 
 
159 aa  127  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0935  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  40.76 
 
 
159 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0918  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  40.76 
 
 
159 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0669251  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1230  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  39.49 
 
 
159 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.560314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0070  MaoC-like dehydratase  38.46 
 
 
182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112282  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0842  MaoC-like dehydratase  36.36 
 
 
180 aa  106  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.659825  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0673  MaoC-like dehydratase  38.19 
 
 
177 aa  103  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0686  dehydratase  38.19 
 
 
177 aa  103  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.169172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0666  dehydratase  38.19 
 
 
177 aa  103  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5413  dehydratase  35.19 
 
 
343 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5703  dehydratase  35.19 
 
 
343 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4333  hypothetical protein  35.66 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5324  MaoC-like dehydratase  35.19 
 
 
343 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2693  MaoC domain protein dehydratase  35.33 
 
 
150 aa  97.1  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0738  MaoC domain protein dehydratase  31.85 
 
 
188 aa  95.1  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0464  MaoC domain protein dehydratase  37.06 
 
 
339 aa  94  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.919633  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3027  hypothetical protein  37.96 
 
 
157 aa  92.8  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1106  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 
352 aa  91.7  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212723  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2739  hypothetical protein  37.41 
 
 
153 aa  91.3  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705553 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3941  hypothetical protein  33.57 
 
 
156 aa  89  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4084  hypothetical protein  30.43 
 
 
185 aa  87.8  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4530  hypothetical protein  36.81 
 
 
148 aa  86.3  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.877257  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5844  dehydratase  36.76 
 
 
343 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0288  hypothetical protein  35.71 
 
 
145 aa  85.5  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0898  hypothetical protein  32.17 
 
 
165 aa  85.1  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.246332 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07680  hypothetical protein  38.6 
 
 
167 aa  84.7  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0469422 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17520  hypothetical protein  32.62 
 
 
147 aa  84.3  9e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.414084  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10515  hypothetical protein  33.09 
 
 
166 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2666  hypothetical protein  31.47 
 
 
152 aa  83.6  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.509352  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0994  dehydratase  35.62 
 
 
343 aa  80.9  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1009  hypothetical protein  30.77 
 
 
149 aa  80.5  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6647  hypothetical protein  33.57 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5102  hypothetical protein  29.73 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2042  normal  0.841887 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0357  MaoC domain-containing protein dehydratase  31.97 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03550  acyl dehydratase  30.77 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413413  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1060  hypothetical protein  30.77 
 
 
158 aa  77  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353069  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0599  MaoC-like dehydratase  36.84 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.598373  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0741  MaoC-like dehydratase  27.89 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244833  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6066  hypothetical protein  30.77 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.421262  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3183  MaoC domain protein dehydratase  33.83 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0253382 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4363  MaoC domain protein dehydratase  27.97 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0562  hypothetical protein  29.41 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0892456  normal  0.0661028 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4038  MaoC-like dehydratase  34.33 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21400  acyl dehydratase  28.23 
 
 
149 aa  63.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0000186279  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4154  MaoC domain protein dehydratase  33.58 
 
 
144 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.540186  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4181  MaoC domain protein dehydratase  33.58 
 
 
144 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155418  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0664  hypothetical protein  35.87 
 
 
153 aa  62.4  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00923819  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2678  hypothetical protein  27.97 
 
 
159 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0349464 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0160  MaoC domain protein dehydratase  30.71 
 
 
151 aa  57.8  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.424795  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0564  hypothetical protein  29.45 
 
 
153 aa  57.8  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21190  acyl dehydratase  26.24 
 
 
180 aa  57.4  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0663  hypothetical protein  27.56 
 
 
146 aa  57  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595218  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0670  hypothetical protein  27.33 
 
 
133 aa  55.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0367273  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0390  MaoC-like dehydratase  33.83 
 
 
145 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000306687 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2840  MaoC domain protein dehydratase  28.47 
 
 
146 aa  51.2  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4168  hypothetical protein  29.92 
 
 
146 aa  50.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504448  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1563  hypothetical protein  27.89 
 
 
150 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1540  hypothetical protein  27.89 
 
 
150 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.911889  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5026  hypothetical protein  30.16 
 
 
146 aa  48.5  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000215714  normal  0.277815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1511  hypothetical protein  27.21 
 
 
150 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.538962  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2726  hypothetical protein  26.19 
 
 
146 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5769  hypothetical protein  27.5 
 
 
147 aa  45.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  25.23 
 
 
335 aa  45.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6365  hypothetical protein  32.69 
 
 
133 aa  45.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.937275  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2340  dehydratase  29.93 
 
 
297 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321088  decreased coverage  0.00219714 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2528  hypothetical protein  27.94 
 
 
149 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.691181  normal  0.557466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6627  hypothetical protein  25.56 
 
 
158 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251415  normal  0.949835 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3229  hypothetical protein  28.41 
 
 
382 aa  44.3  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.520523  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3987  hypothetical protein  28.57 
 
 
152 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3813  hypothetical protein  23.08 
 
 
148 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0202371  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1609  hypothetical protein  26.96 
 
 
148 aa  43.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2687  hypothetical protein  28.87 
 
 
158 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2873  hypothetical protein  28.87 
 
 
162 aa  41.6  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2780  hypothetical protein  28.87 
 
 
158 aa  41.6  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.189937  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0552  hypothetical protein  26.22 
 
 
348 aa  41.2  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0634  hypothetical protein  26.22 
 
 
348 aa  41.2  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.366687  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4827  MaoC domain protein dehydratase  26.19 
 
 
279 aa  41.2  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0531  hypothetical protein  26.22 
 
 
348 aa  41.2  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.426838  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5645  hypothetical protein  26.22 
 
 
348 aa  41.2  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>