98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0664 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0664  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  296  7e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00923819  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17520  hypothetical protein  59.18 
 
 
147 aa  163  8e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.414084  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2693  MaoC domain protein dehydratase  57.53 
 
 
150 aa  159  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3027  hypothetical protein  53.21 
 
 
157 aa  155  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2739  hypothetical protein  54.61 
 
 
153 aa  155  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705553 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4333  hypothetical protein  52.38 
 
 
148 aa  152  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3941  hypothetical protein  49.66 
 
 
156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07680  hypothetical protein  46.67 
 
 
167 aa  145  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0469422 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3183  MaoC domain protein dehydratase  55.92 
 
 
151 aa  144  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0253382 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21400  acyl dehydratase  54.17 
 
 
149 aa  141  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0000186279  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0599  MaoC-like dehydratase  57.52 
 
 
153 aa  138  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.598373  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5102  hypothetical protein  46.94 
 
 
149 aa  131  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2042  normal  0.841887 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1009  hypothetical protein  44.9 
 
 
149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6647  hypothetical protein  47.59 
 
 
148 aa  128  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4530  hypothetical protein  45.14 
 
 
148 aa  128  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.877257  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0562  hypothetical protein  44.65 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0892456  normal  0.0661028 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2666  hypothetical protein  38.51 
 
 
152 aa  115  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.509352  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0898  hypothetical protein  40.14 
 
 
165 aa  114  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.246332 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0288  hypothetical protein  43.17 
 
 
145 aa  114  6.9999999999999995e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03550  acyl dehydratase  40 
 
 
147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413413  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4363  MaoC domain protein dehydratase  36.11 
 
 
145 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0357  MaoC domain-containing protein dehydratase  37.76 
 
 
149 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0741  MaoC-like dehydratase  37.5 
 
 
148 aa  104  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244833  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21190  acyl dehydratase  42.86 
 
 
180 aa  100  8e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6066  hypothetical protein  38.89 
 
 
151 aa  97.1  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.421262  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0564  hypothetical protein  36.11 
 
 
153 aa  89.7  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0070  MaoC-like dehydratase  35.38 
 
 
182 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112282  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5844  dehydratase  37.93 
 
 
343 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3987  hypothetical protein  34.48 
 
 
152 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10515  hypothetical protein  34.23 
 
 
166 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0994  dehydratase  37.41 
 
 
343 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4084  hypothetical protein  34.81 
 
 
185 aa  80.9  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5324  MaoC-like dehydratase  35.37 
 
 
343 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0920  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  33.06 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117088  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0937  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  33.06 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5703  dehydratase  35.37 
 
 
343 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5413  dehydratase  35.37 
 
 
343 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0948  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  33.33 
 
 
169 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0666  dehydratase  33.1 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0673  MaoC-like dehydratase  33.1 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0686  dehydratase  33.1 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.169172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0842  MaoC-like dehydratase  31.51 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.659825  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5121  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  31.78 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1540  hypothetical protein  35.21 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.911889  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0464  MaoC domain protein dehydratase  35.56 
 
 
339 aa  75.9  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.919633  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1563  hypothetical protein  35.21 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1106  MaoC domain protein dehydratase  29.86 
 
 
352 aa  76.3  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212723  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1060  hypothetical protein  35.77 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353069  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0670  hypothetical protein  35.42 
 
 
133 aa  73.9  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0367273  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1511  hypothetical protein  34.51 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.538962  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1232  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  33.33 
 
 
177 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.581522 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5119  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  35 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10650  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  30.28 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0506433 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0738  MaoC domain protein dehydratase  32.62 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6365  hypothetical protein  38.46 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.937275  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2726  hypothetical protein  33.1 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1609  hypothetical protein  30.2 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0663  hypothetical protein  29.5 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595218  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4168  hypothetical protein  33.77 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504448  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4756  hypothetical protein  32.84 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0156  hypothetical protein  30.34 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0935  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  26.39 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0918  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  26.39 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0669251  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2840  MaoC domain protein dehydratase  34.59 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10648  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  27.91 
 
 
158 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.039671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0946  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  28.57 
 
 
159 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2528  hypothetical protein  31.51 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.691181  normal  0.557466 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3813  hypothetical protein  34.01 
 
 
148 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0202371  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0448  hypothetical protein  32.82 
 
 
170 aa  59.7  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423979  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4077  hypothetical protein  34 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2939  hypothetical protein  27.59 
 
 
150 aa  58.9  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.255552  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5282  MaoC-like dehydratase  35.35 
 
 
285 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4038  MaoC-like dehydratase  40.48 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5769  hypothetical protein  32.14 
 
 
147 aa  58.2  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2678  hypothetical protein  32.82 
 
 
159 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0349464 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4181  MaoC domain protein dehydratase  39.29 
 
 
144 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155418  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4154  MaoC domain protein dehydratase  39.29 
 
 
144 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.540186  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5026  hypothetical protein  30.67 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000215714  normal  0.277815 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4070  hypothetical protein  31.03 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1230  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  28.35 
 
 
159 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.560314 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3723  hypothetical protein  34.25 
 
 
148 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.575869  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6627  hypothetical protein  36.04 
 
 
158 aa  53.9  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251415  normal  0.949835 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  34.62 
 
 
335 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1778  hypothetical protein  27.96 
 
 
149 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3212  MaoC-like dehydratase  36.89 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.388942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3274  dehydratase  36.89 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3223  dehydratase  36.89 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0160  MaoC domain protein dehydratase  28.72 
 
 
151 aa  47.4  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.424795  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2496  hypothetical protein  25.93 
 
 
149 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0390  MaoC-like dehydratase  39.29 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000306687 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3807  putative dehydratase  33.68 
 
 
297 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0490  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  31.63 
 
 
283 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0139  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  34.41 
 
 
297 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0121  dehydratase  34.41 
 
 
297 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6855  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  31.94 
 
 
289 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0612  MaoC domain protein dehydratase  32.33 
 
 
166 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0337105 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1059  dehydratase  32.98 
 
 
141 aa  40.8  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4088  hypothetical protein  33.83 
 
 
166 aa  40.4  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977948  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>