80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5121 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_5121  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  100 
 
 
159 aa  327  4e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0946  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  83.02 
 
 
159 aa  280  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1230  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  84.28 
 
 
159 aa  279  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.560314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0918  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  81.13 
 
 
159 aa  274  3e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0669251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0935  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  81.13 
 
 
159 aa  274  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10648  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  67.3 
 
 
158 aa  220  8e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.039671 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0920  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  50 
 
 
169 aa  143  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117088  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0937  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  50 
 
 
169 aa  143  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10650  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  46.05 
 
 
166 aa  142  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0506433 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0948  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  50 
 
 
169 aa  141  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0842  MaoC-like dehydratase  42.11 
 
 
180 aa  131  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.659825  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10515  hypothetical protein  44.2 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0666  dehydratase  42.76 
 
 
177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0686  dehydratase  42.76 
 
 
177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.169172 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0673  MaoC-like dehydratase  42.76 
 
 
177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1232  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  42.68 
 
 
177 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.581522 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0070  MaoC-like dehydratase  41.78 
 
 
182 aa  127  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112282  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5119  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  43.95 
 
 
185 aa  124  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1106  MaoC domain protein dehydratase  40.14 
 
 
352 aa  110  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212723  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5844  dehydratase  40.79 
 
 
343 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0738  MaoC domain protein dehydratase  38.41 
 
 
188 aa  107  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4084  hypothetical protein  38.1 
 
 
185 aa  106  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5703  dehydratase  40.54 
 
 
343 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5324  MaoC-like dehydratase  40.54 
 
 
343 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5413  dehydratase  40.54 
 
 
343 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0994  dehydratase  38.82 
 
 
343 aa  100  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1009  hypothetical protein  36.62 
 
 
149 aa  100  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0464  MaoC domain protein dehydratase  35.57 
 
 
339 aa  95.9  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.919633  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2739  hypothetical protein  41.6 
 
 
153 aa  93.6  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705553 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4333  hypothetical protein  34.01 
 
 
148 aa  90.1  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3941  hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  89  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2693  MaoC domain protein dehydratase  34.53 
 
 
150 aa  87.4  8e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5102  hypothetical protein  31.08 
 
 
149 aa  85.9  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2042  normal  0.841887 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3027  hypothetical protein  41.67 
 
 
157 aa  84.3  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17520  hypothetical protein  34.35 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.414084  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0288  hypothetical protein  35.97 
 
 
145 aa  80.5  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2666  hypothetical protein  28.76 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.509352  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0898  hypothetical protein  30.28 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.246332 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4363  MaoC domain protein dehydratase  31.03 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4530  hypothetical protein  30.34 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.877257  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0741  MaoC-like dehydratase  33.1 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244833  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0599  MaoC-like dehydratase  34.97 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.598373  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1060  hypothetical protein  30.07 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353069  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0562  hypothetical protein  29.56 
 
 
160 aa  72.8  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0892456  normal  0.0661028 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6066  hypothetical protein  31.51 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.421262  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0357  MaoC domain-containing protein dehydratase  28.97 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6647  hypothetical protein  31.97 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07680  hypothetical protein  34.75 
 
 
167 aa  68.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0469422 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3183  MaoC domain protein dehydratase  32.39 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0253382 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03550  acyl dehydratase  29.25 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413413  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0564  hypothetical protein  27.59 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0663  hypothetical protein  30.77 
 
 
146 aa  58.5  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595218  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0664  hypothetical protein  32.14 
 
 
153 aa  57.4  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00923819  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21190  acyl dehydratase  28.36 
 
 
180 aa  57.4  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2726  hypothetical protein  30.4 
 
 
146 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0160  MaoC domain protein dehydratase  27.69 
 
 
151 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.424795  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6365  hypothetical protein  31 
 
 
133 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.937275  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4154  MaoC domain protein dehydratase  26.67 
 
 
144 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.540186  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4181  MaoC domain protein dehydratase  26.67 
 
 
144 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155418  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21400  acyl dehydratase  25.78 
 
 
149 aa  50.8  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0000186279  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4168  hypothetical protein  28.57 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504448  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0670  hypothetical protein  26.9 
 
 
133 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0367273  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4038  MaoC-like dehydratase  25.93 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1540  hypothetical protein  25.78 
 
 
150 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.911889  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1563  hypothetical protein  25.78 
 
 
150 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2528  hypothetical protein  27.94 
 
 
149 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.691181  normal  0.557466 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1778  hypothetical protein  22.66 
 
 
149 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2840  MaoC domain protein dehydratase  33 
 
 
146 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2939  hypothetical protein  30 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.255552  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  25.83 
 
 
335 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1511  hypothetical protein  25 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.538962  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5769  hypothetical protein  27.5 
 
 
147 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2496  hypothetical protein  24.22 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3987  hypothetical protein  25.62 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0156  hypothetical protein  25.78 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  23.44 
 
 
337 aa  42.4  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2678  hypothetical protein  21.74 
 
 
159 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0349464 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0390  MaoC-like dehydratase  27.41 
 
 
145 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000306687 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5026  hypothetical protein  25.78 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000215714  normal  0.277815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6627  hypothetical protein  22.07 
 
 
158 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251415  normal  0.949835 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>