80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10650 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10650  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  100 
 
 
166 aa  345  2e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0506433 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0937  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  62.65 
 
 
169 aa  233  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0920  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  62.65 
 
 
169 aa  233  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117088  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0948  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  62.65 
 
 
169 aa  230  6e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1232  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  59.76 
 
 
177 aa  216  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.581522 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5119  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  59.76 
 
 
185 aa  211  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10648  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  48.65 
 
 
158 aa  152  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.039671 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0935  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  45.62 
 
 
159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0918  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  45.62 
 
 
159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0669251  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0842  MaoC-like dehydratase  46.9 
 
 
180 aa  144  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.659825  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5121  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  46.05 
 
 
159 aa  142  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0946  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  44.38 
 
 
159 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1230  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  42.5 
 
 
159 aa  134  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.560314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0070  MaoC-like dehydratase  43.75 
 
 
182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112282  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0673  MaoC-like dehydratase  42.07 
 
 
177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0666  dehydratase  42.07 
 
 
177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0686  dehydratase  42.07 
 
 
177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.169172 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10515  hypothetical protein  43.38 
 
 
166 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3027  hypothetical protein  37.93 
 
 
157 aa  104  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2739  hypothetical protein  36.05 
 
 
153 aa  100  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705553 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2693  MaoC domain protein dehydratase  33.11 
 
 
150 aa  97.4  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5324  MaoC-like dehydratase  38.97 
 
 
343 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5413  dehydratase  38.97 
 
 
343 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5703  dehydratase  38.97 
 
 
343 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0464  MaoC domain protein dehydratase  37.86 
 
 
339 aa  92.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.919633  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0738  MaoC domain protein dehydratase  34.75 
 
 
188 aa  92.4  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1106  MaoC domain protein dehydratase  35.92 
 
 
352 aa  92  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212723  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5844  dehydratase  36.76 
 
 
343 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4084  hypothetical protein  32.87 
 
 
185 aa  88.2  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17520  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  87  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.414084  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07680  hypothetical protein  38.32 
 
 
167 aa  85.9  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0469422 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0599  MaoC-like dehydratase  38.1 
 
 
153 aa  85.9  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.598373  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0994  dehydratase  35 
 
 
343 aa  85.1  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3941  hypothetical protein  32.89 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4333  hypothetical protein  32.17 
 
 
148 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0898  hypothetical protein  31.47 
 
 
165 aa  80.1  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.246332 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1009  hypothetical protein  32.43 
 
 
149 aa  80.5  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6066  hypothetical protein  36.3 
 
 
151 aa  79  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.421262  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0288  hypothetical protein  35.38 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0562  hypothetical protein  32.26 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0892456  normal  0.0661028 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4530  hypothetical protein  31.03 
 
 
148 aa  73.6  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.877257  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5102  hypothetical protein  29.05 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2042  normal  0.841887 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21190  acyl dehydratase  31.37 
 
 
180 aa  70.9  0.000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6647  hypothetical protein  28.67 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0663  hypothetical protein  33.07 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595218  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0357  MaoC domain-containing protein dehydratase  29.25 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0160  MaoC domain protein dehydratase  30.82 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.424795  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2666  hypothetical protein  27.27 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.509352  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03550  acyl dehydratase  31.11 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413413  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3183  MaoC domain protein dehydratase  29.27 
 
 
151 aa  63.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0253382 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0564  hypothetical protein  37.5 
 
 
153 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1060  hypothetical protein  27.22 
 
 
158 aa  63.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353069  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0741  MaoC-like dehydratase  27.52 
 
 
148 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244833  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4363  MaoC domain protein dehydratase  27.97 
 
 
145 aa  62.4  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4038  MaoC-like dehydratase  30.77 
 
 
144 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0664  hypothetical protein  31.48 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00923819  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4154  MaoC domain protein dehydratase  30.07 
 
 
144 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.540186  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4181  MaoC domain protein dehydratase  30.07 
 
 
144 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155418  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2726  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5026  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  55.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000215714  normal  0.277815 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0670  hypothetical protein  31.85 
 
 
133 aa  55.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0367273  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21400  acyl dehydratase  24.44 
 
 
149 aa  55.5  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0000186279  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4168  hypothetical protein  30.95 
 
 
146 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504448  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6627  hypothetical protein  30.2 
 
 
158 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251415  normal  0.949835 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2678  hypothetical protein  27.56 
 
 
159 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0349464 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0390  MaoC-like dehydratase  34.46 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000306687 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0156  hypothetical protein  30.3 
 
 
147 aa  51.2  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2528  hypothetical protein  31.16 
 
 
149 aa  50.8  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.691181  normal  0.557466 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1511  hypothetical protein  28.93 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.538962  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1540  hypothetical protein  28.93 
 
 
150 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.911889  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1563  hypothetical protein  28.93 
 
 
150 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5769  hypothetical protein  29.63 
 
 
147 aa  48.1  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1609  hypothetical protein  28.03 
 
 
148 aa  48.1  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1778  hypothetical protein  20.16 
 
 
149 aa  45.4  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  27.01 
 
 
337 aa  44.3  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3987  hypothetical protein  26.12 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2496  hypothetical protein  20.93 
 
 
149 aa  42.4  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  26.92 
 
 
335 aa  42.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2840  MaoC domain protein dehydratase  26.96 
 
 
146 aa  42  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3813  hypothetical protein  24.03 
 
 
148 aa  41.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0202371  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>