94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0562 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0562  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  326  8e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0892456  normal  0.0661028 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07680  hypothetical protein  58.64 
 
 
167 aa  179  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0469422 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2693  MaoC domain protein dehydratase  54.09 
 
 
150 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0599  MaoC-like dehydratase  61.69 
 
 
153 aa  164  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.598373  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3027  hypothetical protein  53.8 
 
 
157 aa  163  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2739  hypothetical protein  55.06 
 
 
153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705553 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4333  hypothetical protein  50 
 
 
148 aa  147  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3941  hypothetical protein  50.63 
 
 
156 aa  147  8e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3183  MaoC domain protein dehydratase  48.1 
 
 
151 aa  144  7.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0253382 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17520  hypothetical protein  45.57 
 
 
147 aa  131  5e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.414084  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6647  hypothetical protein  43.67 
 
 
148 aa  124  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21400  acyl dehydratase  44.74 
 
 
149 aa  120  6e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0000186279  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2666  hypothetical protein  39.24 
 
 
152 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.509352  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5102  hypothetical protein  41.88 
 
 
149 aa  118  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2042  normal  0.841887 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4363  MaoC domain protein dehydratase  39.49 
 
 
145 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4530  hypothetical protein  40.76 
 
 
148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.877257  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03550  acyl dehydratase  39.24 
 
 
147 aa  111  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413413  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1009  hypothetical protein  38.12 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0898  hypothetical protein  38.71 
 
 
165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.246332 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0741  MaoC-like dehydratase  41.4 
 
 
148 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244833  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0357  MaoC domain-containing protein dehydratase  40 
 
 
149 aa  102  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6066  hypothetical protein  42.06 
 
 
151 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.421262  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0664  hypothetical protein  43.04 
 
 
153 aa  99.8  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00923819  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0564  hypothetical protein  36.94 
 
 
153 aa  99.4  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21190  acyl dehydratase  41.5 
 
 
180 aa  97.4  6e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0288  hypothetical protein  39.07 
 
 
145 aa  97.4  7e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0686  dehydratase  34.64 
 
 
177 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.169172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0666  dehydratase  34.64 
 
 
177 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0673  MaoC-like dehydratase  34.64 
 
 
177 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0842  MaoC-like dehydratase  33.99 
 
 
180 aa  91.3  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.659825  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0070  MaoC-like dehydratase  32.03 
 
 
182 aa  87  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112282  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4084  hypothetical protein  34.93 
 
 
185 aa  85.1  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10515  hypothetical protein  30.61 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10648  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  30.43 
 
 
158 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.039671 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2840  MaoC domain protein dehydratase  35.22 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0937  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  31.45 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0920  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  31.45 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117088  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0918  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  33.87 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0669251  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0948  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  31.45 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10650  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  32.26 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0506433 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0935  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  33.87 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5121  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  29.56 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1060  hypothetical protein  32.3 
 
 
158 aa  72  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353069  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0946  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  30.19 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1511  hypothetical protein  33.06 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.538962  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1609  hypothetical protein  29.94 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1563  hypothetical protein  33.06 
 
 
150 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1540  hypothetical protein  33.06 
 
 
150 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.911889  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0994  dehydratase  32.19 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0738  MaoC domain protein dehydratase  31.85 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1232  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  29.41 
 
 
177 aa  65.1  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.581522 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0670  hypothetical protein  28.12 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0367273  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5844  dehydratase  31.51 
 
 
343 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1230  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  29.03 
 
 
159 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.560314 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0663  hypothetical protein  23.57 
 
 
146 aa  60.5  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595218  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2678  hypothetical protein  29.45 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0349464 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0156  hypothetical protein  28.57 
 
 
147 aa  59.7  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5324  MaoC-like dehydratase  31.51 
 
 
343 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5119  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  28.1 
 
 
185 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5703  dehydratase  31.51 
 
 
343 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5413  dehydratase  31.51 
 
 
343 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4181  MaoC domain protein dehydratase  33.62 
 
 
144 aa  57.8  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155418  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4154  MaoC domain protein dehydratase  33.62 
 
 
144 aa  57.8  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.540186  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4038  MaoC-like dehydratase  33.62 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3987  hypothetical protein  29.17 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6365  hypothetical protein  27.74 
 
 
133 aa  54.7  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.937275  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1106  MaoC domain protein dehydratase  27.88 
 
 
352 aa  54.3  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212723  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2726  hypothetical protein  29.2 
 
 
146 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0464  MaoC domain protein dehydratase  31.51 
 
 
339 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.919633  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2528  hypothetical protein  31.21 
 
 
149 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.691181  normal  0.557466 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0390  MaoC-like dehydratase  28.57 
 
 
145 aa  50.8  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000306687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6627  hypothetical protein  28.46 
 
 
158 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251415  normal  0.949835 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0448  hypothetical protein  28.57 
 
 
170 aa  48.9  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423979  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0160  MaoC domain protein dehydratase  29.08 
 
 
151 aa  48.9  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.424795  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4756  hypothetical protein  27.14 
 
 
147 aa  47.8  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  29.13 
 
 
335 aa  47.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3813  hypothetical protein  25.79 
 
 
148 aa  47.4  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0202371  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4070  hypothetical protein  29.11 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  24.84 
 
 
337 aa  45.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2780  hypothetical protein  30.41 
 
 
158 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.189937  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2687  hypothetical protein  30.41 
 
 
158 aa  44.7  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2939  hypothetical protein  25.2 
 
 
150 aa  44.7  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.255552  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5769  hypothetical protein  25.58 
 
 
147 aa  43.9  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3212  MaoC-like dehydratase  31.2 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.388942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3274  dehydratase  31.2 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2873  hypothetical protein  30.18 
 
 
162 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3223  dehydratase  31.2 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  29.17 
 
 
319 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1778  hypothetical protein  23.58 
 
 
149 aa  42.4  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4077  hypothetical protein  24.84 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4168  hypothetical protein  28.99 
 
 
146 aa  41.2  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504448  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3723  hypothetical protein  26.28 
 
 
148 aa  41.2  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.575869  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0665  MaoC domain protein dehydratase  32 
 
 
138 aa  40.8  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0187656  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4362  MaoC domain protein dehydratase  24.19 
 
 
141 aa  40.4  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>