93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4077 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4077  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  303  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3813  hypothetical protein  87.16 
 
 		 148 aa  266  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0202371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3723  hypothetical protein  83.78 
 
 		 148 aa  243  8e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.575869  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0156  hypothetical protein  56.08 
 
 		 147 aa  178  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0663  hypothetical protein  48.3 
 
 		 146 aa  148  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595218  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4070  hypothetical protein  50.68 
 
 		 147 aa  142  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2726  hypothetical protein  45.95 
 
 		 146 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4756  hypothetical protein  46.26 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3987  hypothetical protein  45.89 
 
 		 152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5769  hypothetical protein  44.9 
 
 		 147 aa  130  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2528  hypothetical protein  42.95 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.691181  normal  0.557466 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4168  hypothetical protein  43.92 
 
 		 146 aa  127  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504448  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5026  hypothetical protein  40.54 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000215714  normal  0.277815 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2939  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  118  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.255552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1609  hypothetical protein  41.22 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4038  MaoC-like dehydratase  38.26 
 
 		 144 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4181  MaoC domain protein dehydratase  37.58 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155418  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4154  MaoC domain protein dehydratase  37.58 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.540186  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1540  hypothetical protein  37.16 
 
 		 150 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.911889  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1563  hypothetical protein  37.16 
 
 		 150 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1511  hypothetical protein  36.49 
 
 		 150 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.538962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3223  dehydratase  41.79 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3212  MaoC-like dehydratase  41.79 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.388942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3274  dehydratase  41.79 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0390  MaoC-like dehydratase  37.33 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000306687 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5102  hypothetical protein  33.78 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2042  normal  0.841887 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0448  hypothetical protein  31.79 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03550  acyl dehydratase  32.89 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0160  MaoC domain protein dehydratase  29.71 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.424795  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0741  MaoC-like dehydratase  33.56 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6647  hypothetical protein  35.37 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4530  hypothetical protein  31.76 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.877257  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4333  hypothetical protein  32.65 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0898  hypothetical protein  35.9 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.246332 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2666  hypothetical protein  28.77 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.509352  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3941  hypothetical protein  32.65 
 
 		 156 aa  67  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6066  hypothetical protein  33.11 
 
 		 151 aa  67  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.421262  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3183  MaoC domain protein dehydratase  34.01 
 
 		 151 aa  67  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0253382 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0670  hypothetical protein  36.73 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0367273  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  33.87 
 
 		 335 aa  64.3  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17520  hypothetical protein  31.91 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.414084  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07680  hypothetical protein  33.33 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0469422 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1009  hypothetical protein  32.65 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4363  MaoC domain protein dehydratase  30.41 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  30.77 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2678  hypothetical protein  28.4 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0349464 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2693  MaoC domain protein dehydratase  28.77 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21400  acyl dehydratase  30 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0000186279  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2496  hypothetical protein  25.69 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0564  hypothetical protein  36.45 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2739  hypothetical protein  32.65 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705553 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0664  hypothetical protein  35.4 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00923819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21190  acyl dehydratase  31.47 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0357  MaoC domain-containing protein dehydratase  27.56 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6627  hypothetical protein  29.69 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251415  normal  0.949835 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0070  MaoC-like dehydratase  28.93 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0288  hypothetical protein  26.57 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1060  hypothetical protein  29.13 
 
 		 158 aa  53.5  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353069  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4069  hypothetical protein  30 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.389962  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1778  hypothetical protein  24.11 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0842  MaoC-like dehydratase  29.31 
 
 		 180 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.659825  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3027  hypothetical protein  29.59 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0666  dehydratase  27.78 
 
 		 177 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0686  dehydratase  27.78 
 
 		 177 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.169172 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0673  MaoC-like dehydratase  27.78 
 
 		 177 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4039  hypothetical protein  29.41 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.798553 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0738  MaoC domain protein dehydratase  27.91 
 
 		 188 aa  49.7  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2873  hypothetical protein  26.04 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2780  hypothetical protein  26.04 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.189937  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2840  MaoC domain protein dehydratase  29.2 
 
 		 146 aa  47.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0894  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  37.68 
 
 		 287 aa  47.4  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854145  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10515  hypothetical protein  26.32 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0562  hypothetical protein  25 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0892456  normal  0.0661028 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2687  hypothetical protein  25.44 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0599  MaoC-like dehydratase  27.82 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.598373  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4084  hypothetical protein  23.94 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0920  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  23.85 
 
 		 169 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117088  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0937  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  23.85 
 
 		 169 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4199  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  31.58 
 
 		 288 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  31.54 
 
 		 312 aa  44.3  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1106  MaoC domain protein dehydratase  26.35 
 
 		 352 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212723  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0512  hypothetical protein  29.14 
 
 		 326 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0948  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  19.69 
 
 		 169 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1232  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  20.47 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581522 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2677  dehydratase  35.38 
 
 		 276 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.211797  normal  0.0433405 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10650  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  24.03 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0506433 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.1 
 
 		 710 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10648  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  24.26 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.039671 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  27.78 
 
 		 319 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5703  dehydratase  26.02 
 
 		 343 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5413  dehydratase  26.02 
 
 		 343 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5324  MaoC-like dehydratase  26.02 
 
 		 343 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0490  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  31.43 
 
 		 283 aa  40  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>