85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3723 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3723  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  305  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.575869  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3813  hypothetical protein  85.81 
 
 		 148 aa  264  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0202371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4077  hypothetical protein  83.78 
 
 		 148 aa  244  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0156  hypothetical protein  55.41 
 
 		 147 aa  181  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0663  hypothetical protein  46.94 
 
 		 146 aa  147  7e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595218  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4070  hypothetical protein  50 
 
 		 147 aa  140  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4756  hypothetical protein  44.9 
 
 		 147 aa  131  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2726  hypothetical protein  43.92 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3987  hypothetical protein  45.21 
 
 		 152 aa  130  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2528  hypothetical protein  42.95 
 
 		 149 aa  126  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.691181  normal  0.557466 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5769  hypothetical protein  42.86 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4168  hypothetical protein  41.89 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504448  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5026  hypothetical protein  40.54 
 
 		 146 aa  116  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000215714  normal  0.277815 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2939  hypothetical protein  41.22 
 
 		 150 aa  114  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.255552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1609  hypothetical protein  39.6 
 
 		 148 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1540  hypothetical protein  38.51 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.911889  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1563  hypothetical protein  38.51 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1511  hypothetical protein  37.84 
 
 		 150 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.538962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3212  MaoC-like dehydratase  39.07 
 
 		 152 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.388942  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3223  dehydratase  39.07 
 
 		 152 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3274  dehydratase  39.07 
 
 		 152 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4038  MaoC-like dehydratase  35.57 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4181  MaoC domain protein dehydratase  34.9 
 
 		 144 aa  84.3  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155418  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4154  MaoC domain protein dehydratase  34.9 
 
 		 144 aa  84.3  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.540186  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0448  hypothetical protein  31.79 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03550  acyl dehydratase  33.56 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413413  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5102  hypothetical protein  33.57 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2042  normal  0.841887 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6647  hypothetical protein  36.73 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0390  MaoC-like dehydratase  35.33 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000306687 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0160  MaoC domain protein dehydratase  31.62 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.424795  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4530  hypothetical protein  32.89 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.877257  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2666  hypothetical protein  30.41 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.509352  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3183  MaoC domain protein dehydratase  35.37 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0253382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0741  MaoC-like dehydratase  34.19 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4363  MaoC domain protein dehydratase  31.13 
 
 		 145 aa  67  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0898  hypothetical protein  35.54 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.246332 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1009  hypothetical protein  32.88 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4333  hypothetical protein  33.78 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6066  hypothetical protein  34.93 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.421262  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  34.68 
 
 		 335 aa  64.3  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3941  hypothetical protein  33.78 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2678  hypothetical protein  30.72 
 
 		 159 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0349464 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0670  hypothetical protein  34.69 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0367273  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2693  MaoC domain protein dehydratase  30.14 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  31.54 
 
 		 337 aa  60.5  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21400  acyl dehydratase  30.77 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0000186279  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2496  hypothetical protein  26.21 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07680  hypothetical protein  30 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0469422 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0288  hypothetical protein  27.97 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17520  hypothetical protein  29.08 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.414084  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3027  hypothetical protein  29.1 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0564  hypothetical protein  28.48 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21190  acyl dehydratase  31.25 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0664  hypothetical protein  35.4 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00923819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1060  hypothetical protein  29.51 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353069  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0842  MaoC-like dehydratase  30.09 
 
 		 180 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.659825  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2739  hypothetical protein  33.67 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705553 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6627  hypothetical protein  29.53 
 
 		 158 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251415  normal  0.949835 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4069  hypothetical protein  30.77 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.389962  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4039  hypothetical protein  30.53 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.798553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0070  MaoC-like dehydratase  29.09 
 
 		 182 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0666  dehydratase  28.18 
 
 		 177 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0673  MaoC-like dehydratase  28.18 
 
 		 177 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0562  hypothetical protein  26.28 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0892456  normal  0.0661028 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0686  dehydratase  28.18 
 
 		 177 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.169172 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2873  hypothetical protein  35.62 
 
 		 162 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2780  hypothetical protein  35.62 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.189937  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1778  hypothetical protein  23.4 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2687  hypothetical protein  26.99 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0357  MaoC domain-containing protein dehydratase  25.98 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0599  MaoC-like dehydratase  28.57 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.598373  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0512  hypothetical protein  28.06 
 
 		 326 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  29.71 
 
 		 319 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2840  MaoC domain protein dehydratase  30.09 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10515  hypothetical protein  25.76 
 
 		 166 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0738  MaoC domain protein dehydratase  28.79 
 
 		 188 aa  44.7  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0920  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  23.66 
 
 		 169 aa  43.9  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117088  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0937  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  23.66 
 
 		 169 aa  43.9  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4084  hypothetical protein  23.94 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5844  dehydratase  28.1 
 
 		 343 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4199  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  30.26 
 
 		 288 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0948  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  22.14 
 
 		 169 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1106  MaoC domain protein dehydratase  26.35 
 
 		 352 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212723  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0994  dehydratase  28.93 
 
 		 343 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3852  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  31.25 
 
 		 285 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>