165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3115 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3115  MaoC domain protein dehydratase  100 
 
 
333 aa  646    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2939  MaoC domain protein dehydratase  50.95 
 
 
300 aa  285  5e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34970  acyl dehydratase  49.29 
 
 
339 aa  264  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486477  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3587  MaoC domain protein dehydratase  50.94 
 
 
311 aa  253  4.0000000000000004e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2380  MaoC domain protein dehydratase  54.13 
 
 
317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.087809 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2146  dehydratase  43.65 
 
 
307 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139128  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1893  MaoC domain protein dehydratase  47.84 
 
 
335 aa  218  8.999999999999998e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109024 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23460  acyl dehydratase  44.91 
 
 
301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.260821  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38940  acyl dehydratase  41.57 
 
 
286 aa  183  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.234343 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0197  MaoC domain protein dehydratase  39.49 
 
 
297 aa  172  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2849  dehydratase  40.07 
 
 
288 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0308  MaoC domain protein dehydratase  40.89 
 
 
284 aa  160  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188637  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21230  acyl dehydratase  39.02 
 
 
335 aa  159  5e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0140  dehydratase  42.37 
 
 
297 aa  158  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0146  dehydratase  40.28 
 
 
306 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.861571  decreased coverage  0.0000240434 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6974  MaoC domain protein dehydratase  35.99 
 
 
267 aa  153  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11740  MaoC-like protein  40.91 
 
 
297 aa  150  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0694748  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0619  dehydratase  40.76 
 
 
283 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965685  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4026  MaoC domain protein dehydratase  38.17 
 
 
292 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139302  normal  0.123863 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0625  dehydratase  40.59 
 
 
283 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406567 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2077  dehydratase  36.51 
 
 
291 aa  149  7e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0580  MaoC domain-containing protein  39.92 
 
 
283 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4584  dehydratase  38.91 
 
 
283 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4455  MaoC domain protein dehydratase  37.11 
 
 
296 aa  142  9e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00945579  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0643  MaoC-like dehydratase  38.43 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5510  hypothetical protein  35.89 
 
 
285 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0426  MaoC domain protein dehydratase  37.24 
 
 
294 aa  136  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.252327  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0742  MaoC-like domain protein  36.93 
 
 
285 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81902  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2189  MaoC-like dehydratase  41.18 
 
 
284 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63290  hypothetical protein  36.27 
 
 
285 aa  136  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.230888  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1388  dehydratase  31.66 
 
 
298 aa  135  8e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000424588  unclonable  0.000000000439784 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3157  MaoC-like dehydratase  36.06 
 
 
320 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00547969  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1070  MaoC-like dehydratase  31.3 
 
 
305 aa  134  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000325805  normal  0.560447 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0742  dehydratase  34.77 
 
 
285 aa  133  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.780848  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1760  MaoC domain protein dehydratase  40.25 
 
 
284 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10244  hypothetical protein  33.91 
 
 
280 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0093701  normal  0.943124 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2776  putative (R)-specific enoyl-CoA hydratase, MaoC- like  37.41 
 
 
311 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.272996  normal  0.286691 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0413  dehydratase  32.22 
 
 
282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0697277 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1308  hypothetical protein  31.03 
 
 
305 aa  129  6e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000275009  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0654  MaoC-like dehydratase  33.78 
 
 
284 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3522  dehydratase  31.13 
 
 
288 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0524  MaoC-like dehydratase  33.76 
 
 
289 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000449112  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0239  MaoC-like dehydratase  31.8 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0249  dehydratase  31.8 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1674  MaoC domain protein dehydratase  39.61 
 
 
314 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.394438 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0229  dehydratase  31.8 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200402  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3315  dehydratase  33.62 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000241426  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1689  MaoC domain protein dehydratase  39.57 
 
 
284 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0315419  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0559  dehydratase  33.76 
 
 
287 aa  125  9e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3471  dehydratase  33.76 
 
 
287 aa  125  9e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0558  dehydratase  33.33 
 
 
287 aa  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.742818  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0258  dehydratase  32.22 
 
 
284 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.115215 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3932  dehydratase  33.05 
 
 
276 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.212138  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3750  MaoC domain protein dehydratase  33.05 
 
 
287 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0600605  normal  0.381685 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0518  dehydratase  33.05 
 
 
276 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177397  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3806  dehydratase  32.63 
 
 
276 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000417553  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0559  MaoC domain-containing protein  32.77 
 
 
276 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4341  dehydratase  30.8 
 
 
294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.18708  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3721  dehydratase  31.22 
 
 
288 aa  119  9e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000101981  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03008  MaoC domain protein dehydratase  33.18 
 
 
291 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104203  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3017  MaoC domain-containing protein dehydratase  40.31 
 
 
285 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176864  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3148  MaoC domain-containing protein  32.77 
 
 
287 aa  116  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113837  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0430  MaoC domain protein dehydratase  35.43 
 
 
306 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183193  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0611  dehydratase  29.38 
 
 
288 aa  114  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000129975  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0441  dehydratase  31.93 
 
 
279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000513118  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1702  dehydratase  39.25 
 
 
305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00665806  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0415  MaoC domain protein dehydratase  37.44 
 
 
306 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134356 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1258  dehydratase  34.8 
 
 
280 aa  98.6  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196595  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3954  dehydratase  31.41 
 
 
293 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21274  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3316  hypothetical protein  33.71 
 
 
297 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2103  hypothetical protein  28.57 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0785743  normal  0.016568 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0671  dehydratase  46.67 
 
 
127 aa  56.2  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0318034  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6364  MaoC domain-containing protein dehydratase  47.89 
 
 
131 aa  55.8  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.91527  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4827  MaoC domain protein dehydratase  31.58 
 
 
279 aa  55.8  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0899  MaoC domain protein dehydratase  45.07 
 
 
142 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344654  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21310  hypothetical protein  45.21 
 
 
156 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288859  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0665  MaoC domain protein dehydratase  38.75 
 
 
138 aa  54.7  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0187656  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1081  dehydratase  36.71 
 
 
135 aa  53.5  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5103  MaoC domain protein dehydratase  43.08 
 
 
142 aa  53.5  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300678  normal  0.830614 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1594  dehydratase  41.89 
 
 
161 aa  53.5  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.691822  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1822  hypothetical protein  47.69 
 
 
156 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5970  MaoC domain protein dehydratase  45.21 
 
 
155 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0874793  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3568  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  43.42 
 
 
500 aa  51.2  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1493  dehydratase  42.47 
 
 
156 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0447243  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2926  putative MaoC-like dehydratase  33.93 
 
 
147 aa  51.6  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.997708  normal  0.0377556 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4356  MaoC-like dehydratase  45.07 
 
 
156 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3661  dehydratase  46.03 
 
 
148 aa  50.8  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.831738  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3940  dehydratase  40 
 
 
130 aa  50.8  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4332  dehydratase  40 
 
 
130 aa  50.8  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3364  MaoC-like dehydratase  46.03 
 
 
147 aa  50.4  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.975509  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4044  MaoC-like dehydratase  37.62 
 
 
155 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.738131  normal  0.82003 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0289  dehydratase  38.27 
 
 
155 aa  50.1  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4100  MaoC-like domain protein  43.84 
 
 
173 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5194  dehydratase  43.84 
 
 
154 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477522  normal  0.0490486 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0464  MaoC domain protein dehydratase  37.04 
 
 
339 aa  49.3  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.919633  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4529  MaoC domain protein dehydratase  44.62 
 
 
142 aa  49.3  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3444  dehydratase  41.56 
 
 
157 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.523272  normal  0.0613814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3753  MaoC domain protein dehydratase  41.56 
 
 
157 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3847  dehydratase  42.47 
 
 
156 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3838  MaoC-like dehydratase  43.84 
 
 
156 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>