More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0604 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0604  dehydratase  100 
 
 		 151 aa  308  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4870  dehydratase  92.72 
 
 		 151 aa  286  7e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4692  dehydratase  92.05 
 
 		 151 aa  285  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4817  MaoC domain-containing protein  92.05 
 
 		 151 aa  284  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4982  MaoC-like dehydratase  88.74 
 
 		 151 aa  280  5.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0635  MaoC-like dehydratase  81.46 
 
 		 151 aa  263  5e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0734  MaoC-like domain protein  80.79 
 
 		 151 aa  258  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0917658  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3810  dehydratase  77.48 
 
 		 151 aa  248  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.511193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1094  hypothetical protein  76.16 
 
 		 151 aa  241  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00316443  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11910  hypothetical protein  76.16 
 
 		 151 aa  241  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0480105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2161  MaoC-like dehydratase  54.9 
 
 		 152 aa  160  5.0000000000000005e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0601335  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3180  MaoC-like dehydratase  54 
 
 		 153 aa  160  6e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1649  dehydratase  49.66 
 
 		 152 aa  157  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.195889  normal  0.818072 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16780  acyl dehydratase  52.74 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1858  Enoyl-CoA hydratase  53.19 
 
 		 150 aa  145  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0620  Enoyl-CoA hydratase  46.58 
 
 		 151 aa  143  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1474  Enoyl-CoA hydratase  53.15 
 
 		 150 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.118864  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1577  dehydratase  47.62 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0775031  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1389  MaoC-like dehydratase  48.61 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491643  normal  0.42325 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5106  MaoC domain protein dehydratase  50 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0758  Enoyl-CoA hydratase  47.95 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10131  hypothetical protein  46.81 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2479  MaoC domain protein dehydratase  48.3 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.405573  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3583  nodN-like protein  44.67 
 
 		 159 aa  140  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.234832 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3206  MaoC-like dehydratase  50.36 
 
 		 166 aa  140  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2249  MaoC-like dehydratase  47.52 
 
 		 154 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.135818 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1668  dehydratase  47.22 
 
 		 194 aa  140  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0958  hypothetical protein  47.62 
 
 		 151 aa  140  8e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2155  MaoC-like dehydratase  47.83 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3967  Enoyl-CoA hydratase  52.08 
 
 		 150 aa  138  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2065  dehydratase  44.74 
 
 		 153 aa  137  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1346  dehydratase  48.67 
 
 		 148 aa  135  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3913  dehydratase  46.81 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834878 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3089  MaoC-like dehydratase  47.83 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.767095  normal  0.110769 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0839  MaoC domain protein dehydratase  51.45 
 
 		 153 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.952766  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2402  MaoC-like dehydratase  47.06 
 
 		 152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18064  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0231  Enoyl-CoA hydratase  49.65 
 
 		 156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.460096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7557  MaoC-like dehydratase  48.95 
 
 		 178 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221212  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3534  dehydratase  49.66 
 
 		 150 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0316427  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1732  dehydratase  47.48 
 
 		 150 aa  133  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1751  MaoC-like dehydratase  47.48 
 
 		 150 aa  133  8e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0260343  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1798  dehydratase  47.48 
 
 		 150 aa  133  8e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701189 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2865  MaoC domain protein dehydratase  47.14 
 
 		 154 aa  133  9e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3542  dehydratase  47.14 
 
 		 154 aa  133  9e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2554  MaoC-like dehydratase  45.33 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.98648  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0947  MaoC-like dehydratase  47.65 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0846  dehydratase  48.91 
 
 		 150 aa  132  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0873  dehydratase  48.23 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.942848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3821  dehydratase  49.64 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2745  dehydratase  45.39 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0438  dehydratase  44.44 
 
 		 164 aa  131  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.15838 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2139  MaoC-like dehydratase  49.24 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0205444  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4374  dehydratase  45.39 
 
 		 150 aa  130  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1240  MaoC-like dehydratase  48.23 
 
 		 151 aa  130  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4641  MaoC domain protein dehydratase  45.39 
 
 		 152 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00972568  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4135  dehydratase  46.9 
 
 		 155 aa  130  6.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.5486  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1152  hypothetical protein  48.65 
 
 		 150 aa  130  9e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2194  MaoC domain protein dehydratase  47.65 
 
 		 159 aa  129  9e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.302832 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4903  MaoC domain protein dehydratase  48.15 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1612  enoyl-CoA hydratase  46.76 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0981  MaoC-like dehydratase  46.36 
 
 		 158 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.34044  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2586  dehydratase  45.39 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.945813  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1571  MaoC-like dehydratase  45.71 
 
 		 151 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745995  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2042  hypothetical protein  46.67 
 
 		 162 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1871  MaoC domain protein dehydratase  46.31 
 
 		 159 aa  127  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.544936  normal  0.36 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1970  dehydratase  42.57 
 
 		 168 aa  125  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4909  Enoyl-CoA hydratase  42.28 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1676  MaoC-like dehydratase  43.45 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.633015  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1690  MaoC-like dehydratase  46.21 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5029  MaoC domain protein dehydratase  42.28 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5858  Enoyl-CoA hydratase  44.68 
 
 		 151 aa  125  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3353  MaoC domain protein dehydratase  42.07 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1444  MaoC-like dehydratase  47.18 
 
 		 162 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0821742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0649  dehydratase  48.2 
 
 		 150 aa  123  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870667  normal  0.318443 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4397  Enoyl-CoA hydratase  46.04 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.124915  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4410  dehydratase  43.17 
 
 		 157 aa  122  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2169  dehydratase  48.18 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3655  MaoC domain protein dehydratase  42.47 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0104771  normal  0.224277 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1365  MaoC domain protein dehydratase  47.45 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146168  hitchhiker  0.00131877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5640  Enoyl-CoA hydratase  42.95 
 
 		 151 aa  121  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0126  enoyl-CoA hydratase  49.65 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.787557 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3635  dehydratase  45.99 
 
 		 158 aa  120  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.657671 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1389  dehydratase  45.64 
 
 		 158 aa  120  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0968  nodulation protein N, putative  45.64 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0773042  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3189  putative nodulation-related acyl dehydratase, MaoC/NodN-like  46.72 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0908  putative nodulation protein N  45.64 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1809  MaoC family protein  46.21 
 
 		 160 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0345748  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1456  MaoC-like domain-containing protein  46.21 
 
 		 160 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0433  MaoC family protein  46.21 
 
 		 160 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1081  MaoC family protein  45.52 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1150  MaoC family protein  46.21 
 
 		 160 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0717  MaoC family protein  46.21 
 
 		 160 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1319  MaoC domain-containing protein  46.21 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.745158  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4109  dehydratase  44.85 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.202946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3837  MaoC-like dehydratase  43.75 
 
 		 151 aa  117  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101084  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1606  MaoC domain protein dehydratase  44.14 
 
 		 153 aa  116  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00168031  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1310  MaoC domain-containing protein  45.52 
 
 		 160 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0296  Enoyl-CoA hydratase  45.19 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.697257  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2146  dehydratase  46.21 
 
 		 158 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235602  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1989  dehydratase  44.2 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.720073  normal  0.568461 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>