More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4298 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  51.09 
 
 		 814 aa  860    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 824 aa  1680    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3331  TonB-dependent siderophore receptor  40.43 
 
 		 766 aa  545  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153274  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  28.85 
 
 		 789 aa  314  4.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  27.42 
 
 		 791 aa  291  5.0000000000000004e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  29.61 
 
 		 769 aa  272  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  29.03 
 
 		 815 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  28.61 
 
 		 817 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  25.29 
 
 		 807 aa  255  2.0000000000000002e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  27.26 
 
 		 809 aa  251  5e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 793 aa  250  7e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  26.33 
 
 		 907 aa  244  5e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  27.9 
 
 		 825 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2470  TonB-dependent siderophore receptor  26.12 
 
 		 794 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.555764  normal  0.521946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  26.8 
 
 		 795 aa  241  4e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  27.99 
 
 		 860 aa  240  9e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  26.67 
 
 		 785 aa  240  9e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  27.81 
 
 		 825 aa  239  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  27.05 
 
 		 776 aa  238  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1729  TonB-dependent siderophore receptor  26.63 
 
 		 852 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5681  TonB-dependent siderophore receptor  25.41 
 
 		 786 aa  236  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0807191 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  27.63 
 
 		 737 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  26.61 
 
 		 806 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  28.17 
 
 		 742 aa  234  6e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01148  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.66 
 
 		 708 aa  233  8.000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0846293  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  27.15 
 
 		 748 aa  233  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  27.15 
 
 		 748 aa  233  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2461  TonB-dependent siderophore receptor  27.58 
 
 		 713 aa  232  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  25.64 
 
 		 711 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  27.02 
 
 		 749 aa  232  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6718  TonB-dependent siderophore receptor  25.62 
 
 		 805 aa  231  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.960052 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  27.44 
 
 		 738 aa  231  4e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  25.67 
 
 		 708 aa  231  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  25.84 
 
 		 708 aa  231  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  27.13 
 
 		 740 aa  230  7e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  27.9 
 
 		 742 aa  230  7e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  25.93 
 
 		 812 aa  229  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  26.53 
 
 		 782 aa  229  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  25.39 
 
 		 703 aa  228  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  28.16 
 
 		 862 aa  226  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2119  TonB-dependent siderophore receptor  26.02 
 
 		 810 aa  226  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  24.7 
 
 		 709 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1527  TonB-dependent siderophore receptor  26.88 
 
 		 714 aa  224  7e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.698269  normal  0.163231 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0391  TonB-dependent siderophore receptor  27.03 
 
 		 712 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.196206  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  26.2 
 
 		 810 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  25.8 
 
 		 708 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  28.23 
 
 		 726 aa  220  8.999999999999998e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  26.53 
 
 		 711 aa  219  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  26.66 
 
 		 701 aa  218  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  26.4 
 
 		 696 aa  218  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  28.03 
 
 		 726 aa  218  5e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  24.87 
 
 		 709 aa  218  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  26.39 
 
 		 696 aa  217  7e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  27.11 
 
 		 809 aa  216  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5138  TonB-dependent siderophore receptor  26.18 
 
 		 789 aa  216  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0272944 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  25.54 
 
 		 701 aa  213  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  26.77 
 
 		 701 aa  213  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2785  TonB-dependent siderophore receptor  25.03 
 
 		 786 aa  213  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00424821  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  27.2 
 
 		 743 aa  212  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  25.84 
 
 		 710 aa  211  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  26.54 
 
 		 806 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  25.99 
 
 		 808 aa  207  5e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  26.82 
 
 		 819 aa  207  8e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  26.26 
 
 		 710 aa  204  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  26.7 
 
 		 792 aa  204  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.87 
 
 		 703 aa  204  8e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  28.05 
 
 		 707 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  25.73 
 
 		 734 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  25.47 
 
 		 703 aa  202  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  26.88 
 
 		 709 aa  202  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  25.75 
 
 		 723 aa  201  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  26.81 
 
 		 757 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  26.9 
 
 		 712 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 714 aa  196  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  26.95 
 
 		 689 aa  196  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  25.99 
 
 		 733 aa  195  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  27.26 
 
 		 703 aa  194  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  25.48 
 
 		 724 aa  194  5e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.63 
 
 		 711 aa  193  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  25.34 
 
 		 724 aa  193  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  26.45 
 
 		 799 aa  192  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  25.5 
 
 		 829 aa  192  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  25.65 
 
 		 700 aa  191  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  25.76 
 
 		 706 aa  191  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  25.76 
 
 		 706 aa  191  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  25.03 
 
 		 801 aa  191  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  24.87 
 
 		 732 aa  191  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  26.23 
 
 		 713 aa  191  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  26.39 
 
 		 720 aa  191  7e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  26.58 
 
 		 806 aa  190  9e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  25.8 
 
 		 692 aa  189  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  26.77 
 
 		 701 aa  190  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6108  TonB-dependent siderophore receptor  25.21 
 
 		 796 aa  190  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0688  TonB-dependent receptor protein  25.23 
 
 		 716 aa  189  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  26.83 
 
 		 694 aa  188  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  25.8 
 
 		 810 aa  188  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  26.32 
 
 		 720 aa  187  5e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  25.69 
 
 		 720 aa  187  6e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  26.59 
 
 		 698 aa  187  8e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  27.34 
 
 		 817 aa  187  9e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>