More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0867 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0867  HflC protein  100 
 
 		 282 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00264104  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  66.79 
 
 		 283 aa  397  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  64.16 
 
 		 284 aa  383  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  59.14 
 
 		 282 aa  363  1e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  54.44 
 
 		 283 aa  310  1e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0264  HflC protein  54.41 
 
 		 282 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  47.04 
 
 		 300 aa  250  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  43.88 
 
 		 290 aa  242  6e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  39.36 
 
 		 290 aa  238  1e-61  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1320  HflC protein  40 
 
 		 286 aa  231  1e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.422043  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1051  hflC protein  38.87 
 
 		 289 aa  224  1e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  40.53 
 
 		 308 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2023  HflC protein  40.96 
 
 		 292 aa  224  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  40.15 
 
 		 318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  39.93 
 
 		 300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0629  HflC protein  41.8 
 
 		 283 aa  219  3e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  45.22 
 
 		 292 aa  218  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  39.39 
 
 		 300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  42.65 
 
 		 295 aa  216  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6096  protease activity modulator HflK  40.16 
 
 		 311 aa  216  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  39.39 
 
 		 311 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  40 
 
 		 284 aa  214  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  40.89 
 
 		 302 aa  211  7.999999999999999e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  40.89 
 
 		 304 aa  211  7.999999999999999e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0002  HflC protein  41.49 
 
 		 281 aa  211  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  38.1 
 
 		 283 aa  209  3e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  38.1 
 
 		 283 aa  209  3e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0165  HflC protein  39.93 
 
 		 286 aa  209  3e-53  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225021  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  42.42 
 
 		 293 aa  208  9e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0605  HflC protein  41.18 
 
 		 312 aa  207  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0249897 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2727  HflC protein  38.67 
 
 		 299 aa  206  4e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772067  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0703  HflC protein  38.46 
 
 		 281 aa  202  5e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2348  hypothetical protein  39.11 
 
 		 298 aa  202  6e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  41.58 
 
 		 293 aa  202  7e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3172  HflC protein  39.27 
 
 		 300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  42.24 
 
 		 293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2263  HflC protein  35.91 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00649366  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1887  hflC protein  36.69 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0578137  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  43.37 
 
 		 294 aa  194  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1562  HflC protein  36.69 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000166482 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  39.1 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1955  HflC protein  38.55 
 
 		 294 aa  194  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.905613  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1731  HflC protein  39.37 
 
 		 295 aa  192  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000316611 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  39.25 
 
 		 303 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  41.2 
 
 		 298 aa  192  6e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  41.97 
 
 		 289 aa  191  8e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0832  hflC protein  37.59 
 
 		 290 aa  191  1e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.379816  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3385  HflC protein  39.52 
 
 		 306 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2664  protease subunit HflC  38.08 
 
 		 291 aa  189  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1980  hflC protein  38.85 
 
 		 287 aa  189  5e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  41.24 
 
 		 289 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  40.55 
 
 		 287 aa  188  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2860  HflC protein  36.57 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2657  HflC protein  37.5 
 
 		 316 aa  186  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.267381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2884  HflC protein  37.5 
 
 		 313 aa  186  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4528  HflC protein  36.59 
 
 		 325 aa  185  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.788095 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  36.5 
 
 		 297 aa  185  7e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  37.76 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1088  HflC protein  36.84 
 
 		 328 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0526  hypothetical protein  40.73 
 
 		 289 aa  183  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  37.74 
 
 		 289 aa  183  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  38.52 
 
 		 304 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1988  putative serine protease transmembrane protein  38.17 
 
 		 296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0922969  normal  0.083656 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4682  HflC protein  40.68 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  38.83 
 
 		 293 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0356  HflC protein  35.36 
 
 		 340 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.534146  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2000  HflC protein  35.36 
 
 		 340 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.491743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02635  HflC protein  38.18 
 
 		 282 aa  179  4e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0702  HflC protein  37.35 
 
 		 310 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.999552  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0886  HflC protein  35.36 
 
 		 340 aa  178  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.340526 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3345  HflC protein  35.04 
 
 		 281 aa  177  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2779  HflC protein  36.03 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5670  protease subunit HflC  40.36 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4943  HflC protein  39.86 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429597 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0666  HflC protein  33.33 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2735  protein hflC  35.21 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0491808  normal  0.0307139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4891  HflC protein  39.86 
 
 		 289 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0674  HflC protein  37.45 
 
 		 289 aa  176  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4767  HflC protein  39.86 
 
 		 289 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2774  HflC protein  35.99 
 
 		 294 aa  176  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65270  protease subunit HflC  40 
 
 		 289 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3015  HflC protein  36.88 
 
 		 287 aa  174  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.698845  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  37.36 
 
 		 295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1283  HflC protein  37.09 
 
 		 289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.368114  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  35.74 
 
 		 291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3523  HflC protein  30.69 
 
 		 313 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  35.51 
 
 		 292 aa  172  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1067  HflC protein  38.52 
 
 		 304 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  37.18 
 
 		 297 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  37.18 
 
 		 297 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  36.1 
 
 		 297 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3277  HflC protein  38.24 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000125944  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1159  HflC protein  37.55 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  34.3 
 
 		 297 aa  170  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2299  HflC protein  36.67 
 
 		 299 aa  170  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783703  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  35.38 
 
 		 294 aa  170  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  34.28 
 
 		 288 aa  169  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4126  HflC protein  35.36 
 
 		 320 aa  169  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2010  HflC protein  38.69 
 
 		 293 aa  169  5e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0721507  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0638  HflC protein  39.64 
 
 		 289 aa  169  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0112821 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>